Streptococcus pneumoniae as a Cause of Community-Acquired Pneumonia: Changes Over the Past 100 Years
Notice bibliographique
Résumé
In the preantibiotic era, Streptococcus pneumoniae (Sp) was responsible for >90% of community-acquired pneumonia (CAP). Modern studies identify Sp in only 5–14% of CAP in the United States (US) and Canada and 15–35% in Europe. PubMed and Google Scholar were searched for studies reporting the etiologic spectrum of CAP in adults in the US, Canada, or Europe. Inclusion of each study required the use of a conventional case definition for CAP and application of standard microbiologic techniques in >50% of cases. Reports on a single subpopulation (immunocompromised, elderly, etc.) or clinical setting (ICU, outpatient, etc.) were excluded. Thirty-one studies from the US and Canada (21,315 patients) and 41 from Europe (25,183 patients) met inclusion criteria. Included studies were published between 1917 and 2015. In the USA and Canada, the proportion of cases caused by Sp decreased significantly over time (Figure 1A) and was inversely related to the proportion of patients with antibiotic use prior to hospital admission (Pearson’s correlation coefficient -0.76 [95% confidence interval −0.48 to −0.90, P < 0.001]). In the US and Canada, the frequency of Sp has continued to decline during the past 4 decades; in contrast, the frequency of Sp has remained stable in Europe during this time (Figure 1B). The proportion of CAP caused by Sp has declined dramatically in the US and Canada during the past 100 years. The initial decline between 1940 and 1965 may be explained by availability of antibiotics. Potential factors contributing to the continued decline include widespread pneumococcal vaccination and declining rates of smoking. The higher frequency of Sp in Europe may be due to lower vaccination rates in adults and higher rates of smoking. Limitations of the present study include heterogeneity among studies in illness severity, comorbidities, microbiologic testing and prior antibiotic use. Frequency of S. pneumoniae as a cause of community-acquired pneumonia (CAP). A. US and Canada, 1917–2013. B. Comparison between Europe (red) and the US and Canada (blue), 1975–2013. Each circle represents a single study. The area of each circle is proportional to the number of patients in that study. All authors: No reported disclosures.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,012 | 0,032 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,002 |
| Bibliométrie | 0,013 | 0,026 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,002 |
| Communication savante | 0,004 | 0,005 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».