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Enregistrement W2749059461 · doi:10.1016/j.celrep.2017.11.028

Large-Scale Cognitive GWAS Meta-Analysis Reveals Tissue-Specific Neural Expression and Potential Nootropic Drug Targets

2017· article· en· W2749059461 sur OpenAlexafffund
Max Lam, Joey W. Trampush, Jin Yu, Emma Knowles, Gail Davies, David C. Liewald, John M. Starr, Srdjan Djurovic, Ingrid Melle, Kjetil Sundet, Andrea Christoforou, Ivar Reinvang, Pamela DeRosse, Astri J. Lundervold, Vidar M. Steen, Thomas Espeseth, Katri Räikkönen, Elisabeth Widén, Aarno Palotie, Johan G. Eriksson, Ina Giegling, Bettina Konte, Panos Roussos, Stella G. Giakoumaki, Katherine E. Burdick, Antony Payton, William Ollier, Ornit Chiba‐Falek, Deborah K. Attix, Anna C. Need, Elizabeth T. Cirulli, Aristotle N. Voineskos, Nikos C. Stefanis, Dimitrios Avramopoulos, Alex Hatzimanolis, Dan E. Arking, Nikolaos Smyrnis, Robert M. Bilder, Nelson B. Freimer, Tyrone D. Cannon, Edythe London, Russell A. Poldrack, Fred W. Sabb, Eliza Congdon, Emily Drabant Conley, Matthew A. Scult, Dwight Dickinson, Richard E. Straub, Gary Donohoe, Derek W. Morris, Aiden Corvin, Michael Gill, Ahmad R. Hariri, Daniel R. Weinberger, Neil Pendleton, Panos Bitsios, Dan Rujescu, Jari Lahti, Stéphanie Le Hellard, Matthew C. Keller, Ole A. Andreassen, Ian J. Deary, David C. Glahn, Anil K. Malhotra, Todd Lencz

Notice bibliographique

RevueCell Reports · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueChemokine receptors and signaling
Établissements canadiensUniversity of TorontoCentre for Addiction and Mental Health
Organismes subventionnairesNational Center for Research ResourcesNational Institute of Dental and Craniofacial ResearchNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNational Institute of Mental HealthNational Heart, Lung, and Blood InstituteTrinity College, University of OxfordBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilNational Center for Advancing Translational SciencesMedical Research CouncilCanadian Institutes of Health ResearchUniversity of California, Los AngelesNational Institutes of HealthNational Institute on AgingCentre for Cognitive Ageing and Cognitive EpidemiologyNovo Nordisk FondenNational Institute on Alcohol Abuse and AlcoholismUniversity of EdinburghUniversitetet i BergenAcademy of FinlandBergens ForskningsstiftelseTrinity College DublinHelse VestMinistry of EducationNorges ForskningsrådNational Institute on Drug AbuseNovo NordiskUniversity of MinnesotaStiftelsen Kristian Gerhard JebsenNational Science FoundationScience Foundation IrelandJohns Hopkins UniversityFolkhälsanin TutkimussäätiöDirectorate for Biological SciencesGlaxoSmithKlineEllison Medical FoundationCentre for Addiction and Mental Health FoundationCedars-Sinai Medical CenterHelsingin YliopistoFinska LäkaresällskapetEmil Aaltosen SäätiöBoston University
Mots-clésGenome-wide association studyComputational biologyNeuroscienceNootropicDrug discoveryBiologyDrugCognitionBioinformaticsComputer sciencePharmacologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Neurocognitive ability is a fundamental readout of brain function, and cognitive deficits are a critical component of neuropsychiatric disorders, yet neurocognition is poorly understood at the molecular level. In the present report, we present the largest genome-wide association studies (GWAS) of cognitive ability to date (N=107,207), and further enhance signal by combining results with a large-scale GWAS of educational attainment. We identified 70 independent genomic loci associated with cognitive ability, 34 of which were novel. A total of 350 genes were implicated, and this list showed significant enrichment for genes associated with Mendelian disorders with an intellectual disability phenotype. Competitive pathway analysis of gene results implicated the biological process of neurogenesis, as well as the gene targets of two pharmacologic agents: cinnarizine, a T-type calcium channel blocker; and LY97241, a potassium channel inhibitor. Transcriptome-wide analysis revealed that the implicated genes were strongly expressed in neurons, but not astrocytes or oligodendrocytes, and were more strongly associated with fetal brain expression than adult brain expression. Several tissue-specific gene expression relationships to cognitive ability were observed (for example, DAG1 levels in the hippocampus). Finally, we report novel genetic correlations between cognitive ability and disparate phenotypes such as maternal age at first birth and number of children, as well as several autoimmune disorders.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Méta-analyse · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,013

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,006
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,289
Écart entre enseignants0,260 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeMéta-analyse
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations138
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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