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Enregistrement W2749365053 · doi:10.1002/bab.1589

<i>In silico</i>mapping of allosteric ligand binding sites in type‐1 cannabinoid receptor

2017· article· en· W2749365053 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueBiotechnology and Applied Biochemistry · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCannabis and Cannabinoid Research
Établissements canadiensDiscovery Air (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAllosteric regulationIn silicoBinding siteDocking (animal)ChemistryDrug discoveryComputational biologyLigand (biochemistry)StereochemistryHomology modelingAllosteric modulatorBinding pocketSmall moleculeReceptorBiochemistryBiologyEnzymeMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The recent resolution of the crystal structure of type‐1 cannabinoid receptor (CB 1 ) and the discovery of novel modulators for this target open the way to the possibility of elucidating the structural requirements for CB 1 binding, and thereby facilitate a rational drug design. Compounds that target the orthosteric site of CB 1 in some cases have shown side effects. Allosteric modulators could potentially avoid these side effects by influencing binding and/or efficacy of orthosteric ligands. Here, we summarize and compare previous data on different putative allosteric binding sites observed in CB 1 homology models with an in silico docking study of the recently published crystal structure of the same receptor on endogenous and natural hydrophobic ligands that act as positive allosteric modulators and negative allosteric modulators of CB 1 . In particular, a lipid‐exposed pocket targeted by most of the tested molecules is reported and discussed.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil0,561

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,275
Écart entre enseignants0,260 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle