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Enregistrement W2749969842 · doi:10.1016/j.epidem.2017.08.001

Modelling multi-site transmission of the human papillomavirus and its impact on vaccination effectiveness

2017· article· en· W2749969842 sur OpenAlexafffund
Philippe Lemieux-Mellouki, Mélanie Drolet, Mark Jit, G Gingras, Marc Brisson

Notice bibliographique

RevueEpidemics · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCervical Cancer and HPV Research
Établissements canadiensCentre hospitalier de l'Université LavalUniversité Laval
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchPublic Health EnglandNational Institute for Health and Care ResearchNational Institute for Health Research Health Protection Research UnitLondon School of Hygiene and Tropical Medicine
Mots-clésSex organVaccinationHerd immunityTransmission (telecommunications)ImmunityPopulationImmunologyBiologyMedicineVirologyImmune systemEnvironmental healthGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: Previous HPV models have only included genital transmission, when evidence suggests that transmission between several anatomical sites occurs. We compared model predictions of population-level HPV vaccination effectiveness against genital HPV16 infection in women, using a 1) uni-site (genital site), and a 2) multi-site model (genital and one extragenital site). METHODS: We developed a uni-site and a multi-site deterministic HPV transmission model, assuming natural immunity was either site-specific or systemic. Both models were calibrated to genital HPV16 prevalence (5%-7.5%), whilst the multi-site model was calibrated to HPV16 prevalence representative of oral (0%-1%) and anal (1%-7.5%) sites. For each model, we identified 2500 parameter sets that fit endemic genital and extragenital prevalences within pre-specified target ranges. In the Base-case analysis, vaccination was girls-only with 40% coverage. Vaccine efficacy was 100% for all sites with lifetime protection. The outcome was the relative reduction in genital HPV16 prevalence among women at post-vaccination equilibrium (RRprev). RRprev was stratified by extragenital prevalence pre-vaccination. RESULTS: Under assumptions of site-specific immunity, RRprev with the multi-site model was generally greater than with the uni-site model. Differences between the uni-site and multi-site models were greater when transmission from the extragenital site to the genital site was high. Under assumptions of systemic immunity, the multi-site and uni-site models yielded similar RRprev in the scenario without immunity after extragenital infection. In the scenario with systemic immunity after extragenital infection, the multi-site model yielded lower predictions of RRprev than the uni-site model. CONCLUSIONS: Modelling genital-site only transmission may overestimate vaccination impact if extragenital infections contribute to systemic natural immunity or underestimate vaccination impact if a high proportion of genital infections originate from extragenital infections. Under current understanding of heterosexual HPV transmission and immunity, a substantial bias from using uni-site models in predicting vaccination effectiveness against genital HPV infection is unlikely to occur.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,277
Score d'incertitude au seuil0,200

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,105
Tête enseignante GPT0,444
Écart entre enseignants0,339 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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