Genetic diversity and colonization patterns of Onnia tomentosa and Phellinus tremulae (Hymenochaetaceae, Aphyllophorales) in the boreal forest near Thunder Bay, northwestern Ontario
Notice bibliographique
Résumé
Forest health is impacted greatly by fungi, particularly those that cause disease in living trees. By examining genetic diversity within populations of pathogenic fungi and their patterns of colonization it is possible to gain a greater understanding of host-pathogen interactions. Two common pathogens in the boreal forest are Onnia tomentosa, causal agent of a root-rot disease in spruce known as stand opening disease, and Phellinus tremulae, causal agent of white heart rot in stems of trembling aspen. Both fungi are members of the Hymenochaetaceae in the Basidiomycota. \nTwo black spruce (Picea mariana) plantations located north of Nipigon were examined for Onnia tomentosa. Spatial coordinates of 124 basidiomata were taken, and the basidiomata collected from plots that had received different commercial thinning treatments. Using extracted DNA from each of the basidiomata, it was possible to measure genetic diversity and consequently genet size. One hundred and sixteen genetically distinct individuals were found suggesting that the majority of the basidiomata represented unique genets. The distribution pattern was mapped. Stand thinning appears to negatively impact colonization of spruce by O. tomentosa compared with that observed in unthinned control stands. \nIn an ancillary study, a stand of trembling aspen (Populus tremuloides) located at Silver Mountain (74 km SW of Thunder Bay) was examined for Phellinus tremulae. Four infected trees were harvested and each stem cut into 50 cm sections with the top 5 cm from each section removed as a cookie. From each cookie, isolations of P. tremulae were made onto agar media and somatic compatibility techniques were utilized to determine size and distribution of genets in each tree. Two trees contained two genets of P. tremulae, one tree contained a single genet, while the remaining tree failed to yield any isolations of P. tremulae at all.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».