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Enregistrement W2750618109 · doi:10.1055/s-0036-1588526

Fungal Dihydroxynaphthalene-Melanin: Diversity-Oriented Biosynthesis through Enzymatic and Non-enzymatic Transformations

2017· article· en· W2750618109 sur OpenAlexaff
Michael Müller, Syed Masood Husain

Notice bibliographique

RevueSynlett · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMicrobial Natural Products and Biosynthesis
Établissements canadiensDiscovery Centre
Organismes subventionnairesCouncil of Scientific and Industrial Research, India
Mots-clésBiosynthesisChemistryEnzymeBiochemistryTyrosinaseMelaninStereochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Tetrahydroxynaphthalene reductase (T4HNR) from Magnaporthe grisea catalyzes the reduction of polyhydroxynaphthalenes, hydroxynaphthoquinones, and 1,4-diketones, with extensive ramifications for the biosynthesis of (shunt) metabolites related to 1,8-dihydroxynaphthalene (DHN)-melanin biosynthesis. Hence, an extended model for DHN-melanin biosynthesis has been developed which is based on a screening hypothesis involving non-enzymatic transformations such as oxidations and tautomerism. This has led to the broadening of the functions of several short-chain dehydrogenases/reductases (SDRs) capable of reducing polyhydroxyanthracenes, polyhydroxynaphthalenes, and polyhydroxybenzenes. Our work, broadening the scope of enzymatic dearomatization reactions, provides access to the biocatalytic synthesis of a variety of natural and natural-like products. Furthermore, the results described in this account provide the basis for the identification of other SDRs amenable to reducing aromatic compounds, and thus enable the identification of biosynthetic gene clusters most likely involved in the biosynthesis of aromatic polyketides. 1 Introduction 2 Biosynthesis of 1,8-Dihydroxynaphthalene (DHN) 3 Biosynthesis of Shunt Metabolites and the Origin of Molecular Diversity 3.1 Role of Spontaneous Non-enzymatic Oxidations 3.2 Role of T4HNR and T3HNR 3.3 Role of Tautomerism in the Biosynthesis of (Shunt) Metabolites 4 Extended Melanin Biosynthesis: A Screening Hypothesis 5 Useful Outcomes of the Newly Identified Melanin Biosynthetic Pathway 5.1 NADP+ Regeneration Using Lawsone as Mediator 5.2 Anthrahydroquinone as an Intermediate in the Biosynthesis of Chrysophanol and Other Anthraquinone-Derived Products 5.3 Combination of T3HNR and GDH To Access trans-Ketodiols 5.4 Phloroglucinol Reductases (PGRs) To Dearomatize Monomeric Phenols 6 Conclusion

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,254
Écart entre enseignants0,236 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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