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Enregistrement W2750674587 · doi:10.1111/jeb.13174

History rather than hybridization determines population structure and adaptation in <i>Populus balsamifera</i>

2017· article· en· W2750674587 sur OpenAlexaff
Patrick G. Meirmans, Julie Godbout, Manuel Lamothe, Summer L. Thompson, Nathalie Isabel

Notice bibliographique

RevueJournal of Evolutionary Biology · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic diversity and population structure
Établissements canadiensNatural Resources CanadaCanadian Forest Service
Organismes subventionnairesNational Eye InstituteRural Development Administration
Mots-clésGene flowBiologyPopulationLocal adaptationGenetic structureEvolutionary biologyGenetic diversityGenetic admixtureEcologyGenetic variationGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Hybridization between species is known to greatly affect their genetic diversity and, therefore, their evolution. Also, within species, there may be genetic clusters between which gene flow is limited, which may impact natural selection. However, few studies have looked simultaneously at the influence of among-species and within-species gene flow. Here, we study the influence of hybridization between Populus balsamifera and Populus trichocarpa on population structure and adaptation in P. balsamifera. We did this by sampling a total of 1517 individuals from across the ranges of these two species, and by genotyping them using a combination of 93 nuclear and 17 cpDNA SNPs. We found that hybridization is mostly limited to the contact zone where the species' distributions overlap. Within P. balsamifera, we found multiple levels of population structure. Interestingly, the border between the Eastern and Central clusters is very sharp, whereas the border between the Central and Western clusters is diffuse. Outlier analysis revealed that three loci associated with the sharp border were also associated with climate. We hypothesize that the observed clusters derive from three refugia during the Pleistocene ice ages. Between the Central and Western clusters, post-glacial long-distance gene flow has led to the diffusion of their border. In the Eastern cluster, we hypothesize that endogenous genomic barriers have developed, leading to the sharp border and a spurious climate association. We conclude that the large-scale genetic structure of P. balsamifera is mostly shaped by historical factors and the influence of interspecific hybridization is limited.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,052
Score d'incertitude au seuil0,344

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,241
Écart entre enseignants0,224 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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