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Enregistrement W2750992224 · doi:10.1371/journal.pntd.0005876

Spatial distribution, Leishmania species and clinical traits of Cutaneous Leishmaniasis cases in the Colombian army

2017· article· en· W2750992224 sur OpenAlexfundno aff
Luz Helena Patiño, Claudia Méndez, Omaira Rodríguez, Yanira Romero, Daniel Velandia, María Teresa Otero Alvarado, Julie Pérez, María Clara Duque, Juan David Ramírez

Notice bibliographique

RevuePLoS neglected tropical diseases · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueResearch on Leishmaniasis Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesDepartamento Administrativo de Ciencia, Tecnología e Innovación (COLCIENCIAS)Craft Ontario
Mots-clésCutaneous leishmaniasisBiologyLeishmania braziliensisLeishmaniasisLeishmaniaGenotypeZoologyVeterinary medicineGeneticsGeneMedicineParasite hosting

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In Colombia, the cutaneous leishmaniasis (CL) is the most common manifestation across the army personnel. Hence, it is mandatory to determine the species associated with the disease as well as the association with the clinical traits. A total of 273 samples of male patients with CL were included in the study and clinical data of the patients was studied. PCR and sequencing analyses (Cytb and HSP70 genes) were performed to identify the species and the intra-specific genetic variability. A georeferenced database was constructed to identify the spatial distribution of Leishmania species isolated. The identification of five species of Leishmania that circulate in the areas where army personnel are deployed is described. Predominant infecting Leishmania species corresponds to L. braziliensis (61.1%), followed by Leishmania panamensis (33.5%), with a high distribution of both species at geographical and municipal level. The species L. guyanensis, L. mexicana and L. lainsoni were also detected at lower frequency. We also showed the identification of different genotypes within L. braziliensis and L. panamensis. In conclusion, we identified the Leishmania species circulating in the areas where Colombian army personnel are deployed, as well as the high intra-specific genetic variability of L. braziliensis and L. panamensis and how these genotypes are distributed at the geographic level.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,012
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,014
Score d'incertitude au seuil0,997

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,012
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,050
Tête enseignante GPT0,327
Écart entre enseignants0,277 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations83
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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