The Changing Epidemiology of Invasive Pneumococcal Disease Among the Indigenous and Non-indigenous Population of Northwestern Ontario, Canada, from 2006 Through 2015 and Emergence of Non-vaccine Serotypes
Notice bibliographique
Résumé
Rates of invasive pneumococcal disease (IPD) among indigenous populations remain substantially higher than their non-indigenous counterparts. The goal of this study was to analyze the epidemiology and demographic features of IPD in northwestern Ontario (NWO) among the indigenous and non-indigenous population in the context of recent changes in the provincial pneumococcal vaccination programs. Two databases were used to identify cases of IPD in NWO: Thunder Bay Regional Health Sciences Centre and the Thunder Bay District Health Unit. Adult patients with a diagnosis of IPD at the TBRHSC from January 1, 2006 to December 31, 2015 had their medical charts retrospectively reviewed; TBDHU data contained only serotype, age, and gender data. Number of IPD cases and case fatality rate by indigenous status at the TBRHSC, 2006–2015 53 of 182 (29.0%) of patients were indigenous. 35 of 53 (66.0%) of indigenous patients were immunocompromised, whereas 38 of 129 (29.5%) of non-indigenous patients were immunocompromised and the difference was statistically significant (P < 0.001, by chi square test). 35 of 73 (48.0%) of immunocompromised patients were indigenous. Serotype distribution of Streptococcus pneumoniae causing IPD in northwestern Ontario, Canada, 2006–2015 (includes both TBRHSC + TBDHU data). The proportion of non-vaccine serotypes has increased, on average, by 16% per year (P = 0.024, 95% CI: 1.02, 1.32). High rates of IPD were found to occur among immunocompromised indigenous adults in NWO. Our findings identify a vulnerable cohort of the population that would benefit from pneumococcal vaccination coverage. The proportion of non-vaccine serotypes causing IPD has increased during the 10-year observation period. M. Ulanova, Pfizer: Grant Investigator, Grant recipient
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».