Identification of Signaling Pathways Targeted by the Food Contaminant FB1: Transcriptome and Kinome Analysis of Samples from Pig Liver and Intestine
Notice bibliographique
Résumé
SCOPE: Fumonisin B1 (FB1) is a mycotoxin produced by Fusarium species. In mammals, this toxin causes widespread organ-specific damage; it promotes hepatotoxicity, is immunotoxic, alters intestinal functions etc. Despite its inhibitory effect on de novo ceramide synthesis, its molecular mechanism of action and toxicity is not totally elucidated. METHODS AND RESULTS: To explore the mechanism of FB1 toxicity, we analyzed the transcriptome and the kinome of two organs targeted by FB1: the liver and the jejunum. Pigs were fed for 4 weeks a control diet or a FB1-contaminated diet (10 mg/kg). As expected, FB1-exposed pigs gained less weight and displayed a higher sphinganine/sphingosine ratio. Comparison of the transcriptomes and the kinomes of treated versus control pigs showed striking differences. Among the disrupted pathways in liver and jejunum, we highlight Protein Kinase B (AKT) / Phosphatase and tensin homolog (PTEN) at the intersection of the FB1-modulated pathways. CONCLUSION: Most of the effects of FB1 are mediated by the regulation of ceramide level, which influences protein phosphatase 2 (PP2A) and the phosphoinositide 3-kinase (PI3K)/AKT signaling pathway. This pathway might be a new target to counteract toxic effect of Fumonisin B1, which is one of the most spread food contaminant in the world.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».