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Enregistrement W2751202705 · doi:10.1002/mnfr.201700433

Identification of Signaling Pathways Targeted by the Food Contaminant FB1: Transcriptome and Kinome Analysis of Samples from Pig Liver and Intestine

2017· article· en· W2751202705 sur OpenAlexaff
Marion Régnier, Pascal Gourbeyre, Philippe Pinton, Scott Napper, Joëlle Laffite, Anne‐Marie Cossalter, Jean‐Denis Bailly, Yannick Lippi, Justine Bertrand‐Michel, A.P.F.R.L. Bracarense, Hervé Guillou, Nicolas Loiseau, Isabelle P. Oswald

Notice bibliographique

RevueMolecular Nutrition & Food Research · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueMycotoxins in Agriculture and Food
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesAgence Nationale de la Recherche
Mots-clésKinomeBiologyFumonisin B1TranscriptomePI3K/AKT/mTOR pathwaySphingosineProtein kinase BProtein phosphatase 2Signal transductionPTENTensinPhosphataseBiochemistryCell biologyPhosphorylationGeneticsGene expressionReceptorGeneFusarium

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

SCOPE: Fumonisin B1 (FB1) is a mycotoxin produced by Fusarium species. In mammals, this toxin causes widespread organ-specific damage; it promotes hepatotoxicity, is immunotoxic, alters intestinal functions etc. Despite its inhibitory effect on de novo ceramide synthesis, its molecular mechanism of action and toxicity is not totally elucidated. METHODS AND RESULTS: To explore the mechanism of FB1 toxicity, we analyzed the transcriptome and the kinome of two organs targeted by FB1: the liver and the jejunum. Pigs were fed for 4 weeks a control diet or a FB1-contaminated diet (10 mg/kg). As expected, FB1-exposed pigs gained less weight and displayed a higher sphinganine/sphingosine ratio. Comparison of the transcriptomes and the kinomes of treated versus control pigs showed striking differences. Among the disrupted pathways in liver and jejunum, we highlight Protein Kinase B (AKT) / Phosphatase and tensin homolog (PTEN) at the intersection of the FB1-modulated pathways. CONCLUSION: Most of the effects of FB1 are mediated by the regulation of ceramide level, which influences protein phosphatase 2 (PP2A) and the phosphoinositide 3-kinase (PI3K)/AKT signaling pathway. This pathway might be a new target to counteract toxic effect of Fumonisin B1, which is one of the most spread food contaminant in the world.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,167
Score d'incertitude au seuil0,308

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,069
Tête enseignante GPT0,277
Écart entre enseignants0,207 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations33
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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