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Enregistrement W2751228627 · doi:10.1080/00498254.2017.1376260

The effects of UDP-sugars, UDP and Mg<sup>2+</sup>on uridine diphosphate glucuronosyltransferase activity in human liver microsomes

2017· article· en· W2751228627 sur OpenAlexaff
Gurinder Kaur Walia, Alexander D. Smith, Zoe Riches, Abby C. Collier, Michael W.H. Coughtrie

Notice bibliographique

RevueXenobiotica · 2017
Typearticle
Langueen
DomainePharmacology, Toxicology and Pharmaceutics
ThématiquePharmacogenetics and Drug Metabolism
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGlucuronidationUridine diphosphateChemistryGlucuronosyltransferaseEnzymeMicrosomeUridineGlycosyltransferaseBiochemistryGlucuronic acidEnzyme kineticsEnzyme assayActive siteRNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

1. The UDP-glucuronosyltransferase (UGT) enzymes are important in the metabolism, elimination and detoxification of many xenobiotics and endogenous compounds. As extrapolation of in vitro kinetics of drug metabolizing enzymes to predict in vivo clearance rates becomes more sophisticated, it is important to ensure proper optimization of enzyme assays. The luminal location of the enzyme active site (i.e. latency), and the complexity of UGT kinetics, results in consistent under-prediction of clearance of drugs metabolized by glucuronidation.2. We examined inhibition of UGT activity in alamethicin-disrupted human liver microsomes (HLM) by uridine diphosphate (UDP), a UGT reaction product, and its reversal by Mg2+ ions. We also determined whether UDP-sugars other than the co-substrate UDP-glucuronic acid (UDP-GlcA) affected glucuronidation.3. We show that other UDP-sugars do not significantly influence glucuronidation. We also demonstrate that UDP inhibits HLM UGT activity and that this is reversed by including Mg2+ in the assay. The Mg2+ effect can be offset using EDTA, and is dependent on the concentration of UDP-GlcA in the assay.4. We propose that formation of a Mg2+–UDP complex prevents UDP from affecting the enzyme. Our results suggest that 5 mM UDP-GlcA and 10 mM Mg2+ be used for UGT assays in fully disrupted HLM.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,040
Tête enseignante GPT0,380
Écart entre enseignants0,340 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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