A High Density Genetic Map Derived from RAD Sequencing and Its Application in QTL Analysis of Yield-Related Traits in Vigna unguiculata
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
Cowpea [Vigna unguiculata（L.）Walp.], spread widely in the semi-arid tropics, is an annual legume of economic importance. However, high-density genetic maps of cowpea are still in lack. Here, we identified 34,868 SNPs (single nucleotide polymorphisms) that were evenly distributed in the cowpea genome based on the RAD sequencing (restriction-site associated DNA sequencing) technique. Of these SNPs, 17,996 reliable SNPs were allotted to 11 consensus linkage groups (LGs) and were used for genotyping. The length of the genetic map was 1,194.25 cM in total with a mean distance of 0.066 cM/interval locus. The map quality and synteny were compared with the common bean (Phaseolus vulgaris) and the previous cowpea SNP genetic map. Using this map and the F2:3 population, combined with the CIM (composite interval mapping) method, eleven QTLs of yield-related trait were detected on seven LGs (LG4, 5, 6, 7, 9, 10 and 11) in cowpea. These QTLs explained 0.05~17.32% of the total phenotypic variation. Among these, four QTLs were for PL (pod length), four QTLs for TGW (thousand-grain weight), two QTLs for GN (grain number per pod), and one QTL for CL (carpopodium length). Our results will provide a foundation for understanding genes in the cowpea and genus Vigna.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle