MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2751875066 · doi:10.1094/pdis-04-17-0586-re

Development of a Simple Hydroponic Assay to Study Vertical and Horizontal Resistance of Soybean and Pathotypes of <i>Phytophthora sojae</i>

2017· article· en· W2751875066 sur OpenAlexafffund
Amandine Lebreton, C. L’abbé, Maxime de Ronne, Allen Xue, Geneviève Marchand, Richard R. Bélanger

Notice bibliographique

RevuePlant Disease · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Pathogens and Resistance
Établissements canadiensUniversité LavalAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaSaskatchewan Pulse GrowersCanada Research ChairsAgriculture and Agri-Food CanadaEmpresa Brasileira de Pesquisa AgropecuáriaUniversity of GuelphGénome QuébecUniversité LavalWestern Grains Research FoundationCanadian Field Crop Research AllianceGenome CanadaGrain Farmers of Ontario
Mots-clésPhytophthora sojaeBiologyVirulenceInoculationBioassayPhytophthoraSoybean cyst nematodeRoot rotBotanyHorticultureGeneMicrobiologyCultivarGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Phytophthora root rot, caused by Phytophthora sojae, is one of the most damaging diseases of soybean and the introgression of Rps (Resistance to P. sojae) genes into elite soybean lines is arguably the best way to manage this disease. Current bioassays to phenotype the gene-for-gene relationship are hampered with respect to reproducibility and long-term stability of isolates, and do not accurately predict horizontal resistance individually. The aim of our study was to investigate a new way of phenotyping P. sojae isolates and vertical and horizontal resistance in soybean that relies on zoospores inoculated directly into a hydroponic system. Inoculation of P. sojae isolates against a set of eight differentials accurately and reproducibly identified pathotypes over a period of two years. When applied to test vertical resistance of soybean lines with known and unknown Rps genes, the bioassay relied on plant dry weight to correctly identify all genes. In addition, simultaneous inoculations of three P. sojae isolates, collectively carrying eight major virulence factors against 64 soybean lines with known and unknown levels of horizontal resistance, separated the plants into five distinct groups of root rot, allowing the discrimination of lines with various degrees of partial resistance. Based on those results, this bioassay offers several advantages in facilitating efforts in breeding soybean for P. sojae resistance and in identifying virulence factors in P. sojae.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,793
Score d'incertitude au seuil0,162

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,233
Écart entre enseignants0,215 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations38
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuePlant DiseaseMême sujetPlant Pathogens and ResistanceTravaux en français237 207