Identifying Enteropathogens in Children with Acute Gastroenteritis Presenting with Isolated Vomiting–Appetite Study
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background As diarrheal stool samples are the recommended specimen for testing in acute gastroenteritis (AGE), etiological investigations are rarely performed in children presenting with isolated vomiting. This study identifies enteropathogens in children with AGE presenting with isolated vomiting. Methods Children <18 years old with ≥3 episodes of vomiting/diarrhea in 24 hours and <7 days of symptoms were recruited in 2 pediatric emergency departments, a public health clinic and via Health Link, a provincial nurse advice phone line. Rectal swabs and stool samples were collected and tested using the Luminex xTAG GPP, an in-house 5-virus RT-qPCR panel and enteric bacterial culture. Vomiting and diarrhea data were collected at enrollment (day 0) and at day 14. Results Between Dec 9, 2014 and Apr 14, 2016, 2,184 children were enrolled and tested: 784 (36%) presented with isolated vomiting, 250 (11%) with isolated diarrhea (ID), 1,138 (52%) with both vomiting and diarrhea (V&D), 12 had missing data. The detection of enteropathogens was 56% when presenting with isolated vomiting, 55% with ID and 83% with V&D. Of the 784 children with isolated vomiting, 54% (n = 424) had one or more viruses: the most common was norovirus (NoV) (n = 244, 50%), followed by adenovirus (Adv) (91, 19%), rotavirus (Rota) (57, 12%), sapovirus (84, 17%) and astrovirus (10, 2%). Fifty-eight cases had >1 virus; co-infection with NoV and Adv was the most common (n = 23). Ten of these 424 patients also had enteric bacteria (2 Aeromonas, 2 ETEC, 2 Salmonella, 2 Yersinia, 1 Campylobacter, 1 E coli O157) and 8/9 (89%) of these patients reported development of diarrhea at day 14. In comparison, 212/383 (55%) of patients with virus only reported diarrhea at follow up. Enteric bacteria with no virus was detected in 11 patients (3 Aeromonas, 3 Salmonella, 3 STEC, 1 Campylobacter, 1 E coli O157) and 3/10 of these patients reported diarrhea. Conclusion Over 50% of AGE presented with isolated vomiting had enteric virus identified in stool or rectal swabs, representing a significant pathogen-based disease burden not previously included in healthcare planning (e.g., Rota vaccine). NoV was the predominant agent followed by Adv and Rota. Finding enteric bacteria in these cases is novel and requires further study. Disclosures All authors: No reported disclosures.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».