Analysis of two <i>Clostridium difficile</i> outbreaks in an acute health care facility
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Many Clostridium difficile infection (CDI) cases are classified as health care–associated (HA)-CDI using standard definitions. However, this classification may not be accurate and may lead to the declaration of outbreaks when the acquisition of C. difficile is not HA, and the source of infection or strain type are unknown. OBJECTIVE: To characterize C. difficile ribotypes to establish the relationship between CDI cases involved in two outbreaks at a Canadian hospital, and to determine whether there was a common source of infection between the outbreaks. METHODS: C. difficile isolates from infected patients involved in two CDI outbreaks affecting two wards (A and B) were analyzed using ribotyping and mutlilocus sequence typing (MLST) techniques. Antibiotic use and length of hospital stay for the CDI cases during the outbreaks were also analyzed by reviewing patient charts. RESULTS: C. difficile was isolated from 19 of 22 CDI patients. Twelve patients in ward A carried 10 different ribotypes, of which eight were isolated once. Similarly, seven patients in ward B carried five different ribotypes, of which four were isolated once. Only three ribotypes – 027, 056, and 106 – were isolated in both wards, of which at least two isolates of ribotype 027 and ribotype 056 belonged to different MLST groups, indicating genetic diversity, even among the shared ribotypes between the two wards. All CDI patients were isolated throughout their hospital stay. The CDI cases did not show an association with the length of hospital stay. Antibiotic use was also documented before and after the onset of HA-CDI. A common pattern of exposure to multiple antibiotics and proton pump inhibitors was noticed before the onset of CDI that continued afterward. CONCLUSION: Two concurrent CDI outbreaks in two separate wards involving 22 patients admitted to a Canadian acute health care facility in 2012 are reported. On examining these two outbreaks, there was no evidence to support ongoing nosocomial transmission of C. difficile among these patients. The genetic diversity of recovered C. difficile isolates suggested that the outbreaks could not be attributed to a common source or sustained transmission of an outbreak strain.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».