Development of oriC-plasmids for use in Mycoplasma hyorhinis
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Mycoplasma hyorhinis (M. hyorhinis) is an opportunistic pig pathogen, belonging to the class Mollicutes. It causes polyserositis, arthritis and cancers in vitro, increasing attention of the researchers. Currently, there is no available genetic tool to manipulate its genome. This study describes a development of oriC-plasmids harboring either large (pGEMT-LoriC) or minimum (pGEMT-MoriC) origin of replication (oriC) of M. hyorhinis along with tetracycline resistance marker.These plasmids were successfully transformed into M. hyorhinis with average transformation frequency of 1.5 × 10−4 and 2.0 × 10−5 transformants/CFU for pGEMT-LoriC and pGEMT-MoriC respectively, and were integrated at the chromosomal oriC as well as remained freely replicating. We also constructed a Mini-oriC-HT1 targeting plasmid by inclusion of hlyC arms and was used to inactivate hlyC at average frequency of 50%. The efficiency of hlyC inactivation was further improved (by 90%) when Mini-oriC-HT2 that contains E. coli recA was used. In both cases, hemolysin mutant bacteria diminished the ability to lyse mouse RBCs compared to wild-type (P < 0.001). OriC-plasmids described in this study may, therefore open the way for functional genomics in M. hyorhinis. Furthermore, this is a first study demonstrated the gene associated with a hemolytic phenotype in mycoplasmas.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,003 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».