In silico analysis and effects of environmental salinity in the expression and activity of digestive α-amylase and trypsins from the euryhaline crab <i>Neohelice</i> <i>granulata</i>
Notice bibliographique
Résumé
Studies on molecular characteristics and modulation of expression of α-amylase and trypsin in the hepatopancreas of intertidal euryhaline crabs are lacking. In this work, we cloned and studied by in silico approaches the characteristics of cDNA sequences for α-amylase and two trypsins isoforms, as well as the effect of environmental salinity, on gene expression and protein activities in the hepatopancreas of Neohelice granulata (Dana, 1851), which is a good invertebrate model species. The cDNA sequence of α-amylase is 1637 bp long, encoding 459 amino acid residues. Trypsin 1 and 2 are 689 and 1174 bp long, encoding 204 and 151 amino acid residues, respectively. Multiple sequence alignment of deduced protein sequences revealed the presence of conserved motifs found in other invertebrates. In crabs acclimated at 37 psu (hyporegulation), α-amylase mRNA level and total pancreatic amylase activity were higher than at 10 psu (hyperregulation) and 35 psu (osmoconformation). Trypsin 1 mRNA levels increased at 37 psu, while trypsin 2 levels decreased at 10 and 37 psu. Total trypsin activity was similar in all salinities. Our results showed a differential modulation of α-amylase and trypsin expression and total amylase activity by salinity acclimation, suggesting the occurrence of distinct mechanisms of regulation at different levels that could lead to digestive adjustments in relation to hyperregulation and (or) hyporegulation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».