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Enregistrement W2752845267 · doi:10.1128/aac.01666-17

The Global Regulatory Cyclic AMP Receptor Protein (CRP) Controls Multifactorial Fluoroquinolone Susceptibility in Salmonella enterica Serovar Typhimurium

2017· article· en· W2752845267 sur OpenAlexafffund
Stefani C. Kary, Joshua Yoneda, Stephen C. Olshefsky, Laura A. M. Stewart, Steven B. West, Andrew D. S. Cameron

Notice bibliographique

RevueAntimicrobial Agents and Chemotherapy · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAntibiotic Resistance in Bacteria
Établissements canadiensUniversity of Regina
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaSaskatchewan Health Research FoundationGovernment of Canada
Mots-clésDNA supercoilSalmonella entericaEffluxBiologyMicrobiologyTopoisomeraseTopoisomerase IVDNA gyraseCiprofloxacinAntibioticsGeneEscherichia coliDNAGeneticsDNA replication

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Fluoroquinolone antibiotics are prescribed for the treatment of Salmonella enterica infections, but resistance to this family of antibiotics is growing. Here we report that loss of the global regulatory protein cyclic AMP (cAMP) receptor protein (CRP) or its allosteric effector, cAMP, reduces susceptibility to fluoroquinolones. A Δ crp mutation was synergistic with the primary fluoroquinolone resistance allele gyrA83 , thus able to contribute to clinically relevant resistance. Decreased susceptibility to fluoroquinolones could be partly explained by decreased expression of the outer membrane porin genes ompA and ompF with a concomitant increase in the expression of the ciprofloxacin resistance efflux pump gene acrB in Δ crp cells. Expression of gyrAB , which encode the DNA supercoiling enzyme GyrAB, which is blocked by fluoroquinolones, and expression of topA , which encodes the dominant supercoiling-relaxing enzyme topoisomerase I, were unchanged in Δ crp cells. Yet Δ crp cells maintained a more relaxed state of DNA supercoiling, correlating with an observed increase in topoisomerase IV ( parCE ) expression. Surprisingly, the Δ crp mutation had the unanticipated effect of enhancing fitness in the presence of fluoroquinolone antibiotics, which can be explained by the observation that exposure of Δ crp cells to ciprofloxacin had the counterintuitive effect of restoring wild-type levels of DNA supercoiling. Consistent with this, Δ crp cells did not become elongated or induce the SOS response when challenged with ciprofloxacin. These findings implicate the combined action of multiple drug resistance mechanisms in Δ crp cells: reduced permeability and elevated efflux of fluoroquinolones coupled with a relaxed DNA supercoiling state that buffers cells against GyrAB inhibition by fluoroquinolones.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,268
Écart entre enseignants0,257 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations22
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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