Site‐Selective Labeling of Chromium(III) as a Quencher on DNA for Molecular Beacons
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Molecular beacons typically use organic molecules or nanomaterials as quenchers. Many transition‐metal ions have excellent fluorescence quenching ability, and the aim of this study was to recruit them as small quenchers in DNA detection. Cr 3+ has a slow ligand exchange rate, forming stable adducts with DNA. With its strong fluorescence quenching ability, the site‐specific labeling of Cr 3+ on DNA to form a new type of molecular beacon was investigated. The kinetics of quenching by Cr 3+ were measured for single‐ and double‐stranded DNA as a function of salt concentration, pH, and Cr 3+ ion concentration. The goal was to achieve a selective reaction with the single‐stranded but not double‐stranded regions. The reaction mechanism was also probed by adding adenosine triphosphate, revealing two Cr 3+ ‐binding modes: fast but unstable, and slow but stable. A partially complementary duplex was designed with a short polyguanine overhang, which, under optimal conditions, enabled selective labeling of the overhanging region with Cr 3+ . The resulting sequence was tested as a molecular beacon with a detection limit of 0.3 n m DNA and a saturated fluorescence enhancement of fivefold. With a 13‐nucleotide target DNA, the single mismatch discrimination of the beacon was 22‐fold. This study demonstrates the possibility of forming useful Cr 3+ adducts with DNA. Such adducts are not only useful for developing biosensors but also for constructing new materials.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».