Sensitivity of Different Anatomic Sites for Detection and Duration of Colonization with Carbapenemase-Producing Enterobacteriaceae (CPE)
Notice bibliographique
Résumé
CPE are a growing threat worldwide. Screening to identify colonization is critical to control transmission in hospitals, but the sensitivity of screening of different anatomic sites to detect colonization remains uncertain. We describe the results of CPE screening by anatomic site in a study of duration of colonization in Toronto, Canada. The Toronto Invasive Bacterial Diseases Network conducts population-based surveillance of CPE in Toronto/Peel Region. Consenting participants enrolled in the duration of colonization study are screened at enrolment, then q3mo until four consecutive negative swabs are obtained. At each visit, a questionnaire is completed and swabs of groin, rectum and previously positive sites are obtained. Swabs are incubated in BHI broth then planted to MacConkey agar with cefpodoxime. CPE are detected by standard methodology with PCR confirmation. Of 147 eligible patients colonized/infected with CPE, 119 are enrolled, and 465 swab sets have been collected from 99. Overall, 16% (69/434) groin, 21% (92/431) rectal, 27% (22/81) urine, and 17% (9/47) wound cultures yielded CPE. Positive CPE results were obtained in 126 swab sets; in 35 (25%) both rectal and groin yielded CPE, in 57 (45%) only rectal yielded CPE, in 34 (27%) only groin yielded CPE. In 8/22 (36%) culture sets with positive urine specimens CPE was identified only in the urine. Species yield differed by anatomic site, with Klebsiella pneumoniae being detected in 25 (42%) rectal and 34 (58%) groin swabs, and Escherichia coli being detected in 58 (67%) rectal and 29 (33%) groin swabs (P < 0.05). Using rectal swabs only in follow-up would have detected 17/21 (81%) patients followed with both groin/rectal swabs; among 35 urine/groin/rectal specimen sets with at least one swab yielding CPE, 20 (57%) yielded CPE from the rectal swab. Differences in pathogen detection, prevalence, and species suggest multi-site swabbing may be important in identifying CPE colonization. Consistency in the site of detection suggests testing of previously positive sites should not be ignored when assessing duration of colonization. All authors: No reported disclosures.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».