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Enregistrement W2753724262 · doi:10.1093/ofid/ofx163.1897

Vancomycin-resistant Enterococci: Differing Rates and Patterns of Colonization in Liver vs. Non-Liver Solid Organ Transplant

2017· article· en· W2753724262 sur OpenAlexaffabout
Alexandra McFarlane, Dima Kabbani, Stephanie Smith

Notice bibliographique

RevueOpen Forum Infectious Diseases · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAntimicrobial Resistance in Staphylococcus
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineColonizationInternal medicineLiver transplantationIncidence (geometry)PopulationGastroenterologyTransplantationMicrobiologyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Vancomycin-resistant enterococci (VRE) colonization in liver transplant recipients is associated with negative outcomes such as VRE infection, longer hospitalizations, and death. Less is known about VRE colonization in non-liver solid organ transplant (SOT) recipients. The purpose of this study was to describe the epidemiology of VRE colonization in non-liver SOT patients in one major Canadian organ transplant center and compare it to the liver transplant population. Single-center retrospective review of SOT between 2005 and 2015. Cross-referencing of our provincial infection control and SOT databases identified SOT patients who were colonized with VRE during their peri-transplant period. This period was defined as 3 months before to 1 year after transplant. All surveillance cultures, whether positive or negative, and all clinical cultures positive for VRE, were obtained. Patients were considered VRE colonized pre-transplant if they had a positive culture before, or within 48 hours of their transplant. During the study period, there were 663 liver and 1617 non-liver transplants, of which 130 (20%) and 149 (9%) were VRE colonized, respectively (P < 0.001). The rate of VRE colonization in the non-liver group differed by specific organ including: lung/heart–lung 84/437 (19%), heart 17/240 (7%), kidney 36/854 (4%), and miscellaneous 11/86 (13%). The pattern of colonization was different between organs, as depicted in the figure (P < 0.001). Forty-nine percent of liver patients were already colonized before transplant, compared with 17% in non-liver. In all organs, there was a high incidence of new VRE colonization in the immediate post-transplant period. The rate and pattern of VRE colonization differ by transplant organ. Overall rates approach those in the liver cohort for lung/heart–lung, despite no manipulation of the biliary tract, or breach of the peritoneum. Future study should determine risk factors for VRE colonization in non-liver SOT and assess if colonization is associated with worse outcomes in non-liver patients. All authors: No reported disclosures.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,229
Score d'incertitude au seuil0,455

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,283
Écart entre enseignants0,272 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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