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Enregistrement W2753738622 · doi:10.1093/ofid/ofx163.1717

Predictors of Vancomycin-Resistant Enterococcus (VRE) Bacteremia in Ontario, Canada

2017· article· en· W2753738622 sur OpenAlexaffabout
Jennie Johnstone, Cynthia Chen, Laura C. Rosella, Kwaku Adomako, Michelle E. Policarpio, Freda Lam, Chatura Prematunge, Jennifer Robertson, Gary Garber

Notice bibliographique

RevueOpen Forum Infectious Diseases · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAntimicrobial Resistance in Staphylococcus
Établissements canadiensUniversity of OttawaInstitute for Clinical Evaluative SciencesPublic Health Ontario
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineBacteremiaOdds ratioConfidence intervalIntensive care unitEnterococcusVancomycin-resistant EnterococcusInternal medicineEmergency medicinePediatricsVancomycinAntibioticsStaphylococcus aureus

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

To determine predictors of vancomycin resistant enterococcus (VRE) bacteremia in Ontario, Canada. Ontario hospitals are mandated to report VRE bacteremias to a public reporting database. All confirmed VRE bacteremias between January 2009 - December 2013 were linked to provincial health care administrative data sources. A population-based, nested case–control study was performed to determine predictors of VRE bacteremia. Cases were patients with VRE bacteremia and controls were patients with at least one hospital admission during the study period. Each case was matched with up to three controls using frequency matching on age, sex and aggregated diagnosis group. Associations between patient- and hospital-level predictors and VRE bacteremia were estimated by Generalized Estimating Equations and summarized using odds ratios (OR) (adjusted for age, sex, Charlson score, intensive care unit (ICU) admission, length of stay, hospital admission, comorbidities, hospital size and hospital type) and corresponding 95% confidence intervals (CI) in SAS. In total, 232 patients had a VRE bacteremia during the study period; 217 cases were successfully linked to administrative data sources and there were 651 controls. Mean age of cases was 61 years (SD 17) vs. 60 years for controls (SD 21). The proportion of male cases and controls was 60%. Length of stay for cases was longer than controls (median 39 days [range 1–539 days] vs. 3 days [range 1 – 136 days], P < 0.001) and 82% of cases died within 30 days vs. 21% of controls (P < 0.001). In adjusted analyses, patient-level predictors of VRE bacteremia included: organ transplant (OR 18.93 [95% CI 8.37 – 42.79), cancer (OR 9.56 [95% CI 4.61 – 19.79]), ICU admission (OR 7.45 [95% CI 3.57 – 15.54]), heart disease (OR 5.03 [95% CI 1.92 – 13.18]) and length of stay (OR 1.08 per day [95% CI 1.03 – 1.12]); COPD (OR 3.10 [95% CI 0.86 – 11.20]) and diabetes (OR 2.35 [95% CI 0.72 – 7.64]) were not significant predictors. Hospital-level predictors included hospital size ≥800 beds (OR 10.64 [95% CI 2.34 – 48.25]) and teaching hospitals (OR 4.20 [95% CI 1.65 – 10.74]). Immunocompromised and patients admitted to ICU are at highest risk of VRE bacteremia, particularly at large hospitals and teaching hospitals. These results may help inform clinical decisions and infection prevention programs. All authors: No reported disclosures.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,026
Score d'incertitude au seuil0,189

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,003
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,260
Écart entre enseignants0,249 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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