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Enregistrement W2753743058 · doi:10.1186/s12981-017-0168-5

Unlocking HIV-1 Env: implications for antibody attack

2017· review· en· W2753743058 sur OpenAlexafffund
Jonathan Richard, Shilei Ding, Andrés Finzi

Notice bibliographique

RevueAIDS Research and Therapy · 2017
Typereview
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueHIV Research and Treatment
Établissements canadiensMcGill University Health CentreUniversité de MontréalMcGill UniversityCentre Hospitalier de l’Université de Montréal
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchCanada Excellence Research Chairs, Government of Canada
Mots-clésAntibody-dependent cell-mediated cytotoxicityEpitopeHuman immunodeficiency virus (HIV)MicrobicideAntibodyVirologyMedicineAIDS VaccinesLimitingImmunologyHIV vaccineNeutralizing antibodyVaccine trialComputational biologyBiologyMonoclonal antibody

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Collective evidence supporting a role of Antibody-Dependent Cell-Mediated Cytotoxicity (ADCC) in controlling HIV-1 transmission and disease progression emerged in the last few years. Non-neutralizing antibodies (nnAbs) recognizing conserved CD4-induced epitopes on Env and able to mediate potent ADCC against HIV-1-infected cells exposing Env in its CD4-bound conformation have been shown to be present in some RV144 vaccinees and most HIV-1-infected individuals. HIV-1 evolved sophisticated strategies to decrease exposure of this Env conformation by downregulating CD4 and by limiting the overall amount of cell-surface Env. In this review, we will summarize our contribution to this rapidly evolving field, discuss how structural properties of HIV-1 Env might have contributed to the modest efficacy of the RV144 trial and how we recently used this knowledge to develop new strategies aimed at sensitizing HIV-1-infected cells to ADCC mediated by easy to elicit nnAbs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,002
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,390
Tête enseignante GPT0,549
Écart entre enseignants0,159 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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