Evaluation of endometrial carcinoma prognostic immunohistochemistry markers in the context of molecular classification
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Molecular subclassification of endometrial carcinoma (EC) with Proactive Molecular Risk Classifier for Endometrial Cancer (ProMisE) identifies four subtypes [DNA polymerase epsilon (POLE) mutant, mismatch repair‐deficient, p53 wild‐type (wt), and p53 abnormal]. The aim of this study was to evaluate additional EC biomarkers in the context of these subtypes. Tissue microarrays encompassing 460 previously characterized ECs were assessed for L1‐cell adhesion molecule (L1CAM), progesterone receptor (PR), estrogen receptor (ER) alpha, stathmin, and phosphatase and tensin homolog (PTEN), by immunohistochemistry (IHC). Associations with clinicopathological parameters, molecular subtype, and outcomes were determined. About 413 ECs (75% endometrioid, >15% serous) had complete data. L1CAM overexpression was found in 16%, associated with older age, lower body mass index (BMI), advanced stage, grade 3 (97%), non‐endometrioid histology (84%), deep myometrial invasion, lymphovascular space invasion (LVSI), and ER‐negative, PR‐negative status. Tumours overexpressing L1CAM were associated with poor outcomes {hazard ratio (HR) [95% confidence interval (CI)] 3.35 [2.10–5.23] for disease‐specific survival [DSS], p < 0.0001}. PR positivity was associated with younger women, higher BMI, early stage (77% stage I), low grade (61%), endometrioid histology (90%) without LVSI or nodal disease, ER positivity (90%), p53wt tumours (55%), and favourable outcomes [HR (CI) 0.39 (0.25–0.62) for DSS, p < 0.0001]. ER positive tumours were early stage (73%), low grade, endometrioid histology, with improved DSS. Stathmin and PTEN IHC were not associated with outcomes. There was minimal agreement between IHC and mutation status for PTEN. L1CAM overexpression was significantly associated with the p53 abnormal molecular subtype, which accounted for more than 70% of the tumours overexpressing L1CAM. PR expression also correlated with molecular subtype, with most PR negative tumours being p53 abnormal. Multivariable analysis demonstrated that only ProMisE subtype [overall survival (OS), DSS, and progression‐free survival] and age (OS only) maintained an association with outcomes. The prognostic significance of the single biomarkers tested could be explained based on their being covariable with the ProMisE molecular subtype.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».