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Enregistrement W2754543663 · doi:10.1111/are.13481

Molecular isolation and characterization of a haemocyanin of<i>Macrobrachium rosenbergii</i>reveal its antibacterial activities

2017· article· en· W2754543663 sur OpenAlexaff
Chutima Srisuk, Saengchan Senapin, William G. Bendena, Siwaporn Longyant, Paisarn Sithigorngul, Parin Chaivisuthangkura

Notice bibliographique

RevueAquaculture Research · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueInvertebrate Immune Response Mechanisms
Établissements canadiensQueen's University
Organismes subventionnairesThailand Research FundSrinakharinwirot University
Mots-clésBiologyMacrobrachium rosenbergiiPenaeus monodonShrimpOpen reading frameMicrobiologyHemolymphEdwardsiella tardaGenePeptide sequencePrawnBiochemistryFishery

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Haemocyanin is a multi-subunit protein complex found in the haemolymph and is involved in the immune system of crustaceans. In this study, a haemocyanin gene of Macrobrachium rosenbergii, designated MrHc, was successfully isolated. The MrHc gene contained an open reading frame (ORF) of 1,992 nucleotides, encoding a protein of 663 amino acid residues with a molecular mass of 76.5 kDa. The deduced amino acid sequence contained distinct structural motifs of the haemocyanin superfamily, including an all-alpha domain, a copper-containing domain and an immunoglobulin-like domain. Based on the phylogenetic analysis, the MrHC protein demonstrated a close relationship with the haemocyanins of Palaemon carinicauda and Macrobrachium nipponense. The MrHc gene was expressed in various shrimp tissues, including the hepatopancreas, gill, haemocytes, stomach and muscle. After Macrobrachium rosenbergii nodavirus (MrNV) challenge tests, the MrHc gene was up-regulated 237-fold at day 2. A recombinant protein of the MrHc immunoglobulin-like domain exhibited antibacterial activity against Vibrio vulnificus, V. parahaemolyticus, Aeromonas caviae, A. veronii, A. hydrophila and Bacillus cereus. This study suggested that MrHc may play important roles in the shrimp innate immune response to MrNV infection and bacterial infection.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,028
Score d'incertitude au seuil0,544

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,318
Écart entre enseignants0,287 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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