Gene-Set Reduction for Analysis of Major and Minor Gleason Scores Based on Differential Gene-Set Expressions and Biological Pathways in Prostate Cancer
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Notice bibliographique
Résumé
The Gleason score (GS) plays an important role in prostate cancer detection and treatment. It is calculated based on a sum between its major and minor components, each ranging from 1 to 5, assigned after examination of sample cells taken from each side of the prostate gland during biopsy. A total GS of at least 7 is associated with more aggressive prostate cancer. However, it is still unclear how prostate cancer outcomes differ for various distributions of GS between its major and minor components. This article applies Significance Analysis of Microarray for Gene-Set Reduction to a real microarray study of patients with prostate cancer and identifies 13 core genes differentially expressed between patients with a major GS of 3 and a minor GS of 4, or (3,4), vs patients with a combination of (4,3), starting from a less aggressive GS combination of (3,3), and moving toward a more aggressive one of (4,4) via gray areas of (3,4) and (4,3). The resulting core genes may improve understanding of prostate cancer in patients with a total GS of 7, the most common grade and most challenging with respect to prognosis.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle