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Enregistrement W2755110196 · doi:10.1139/facets-2017-0022

Prelude to a panzootic: Gene flow and immunogenetic variation in northern little brown myotis vulnerable to bat white-nose syndrome

2017· article· en· W2755110196 sur OpenAlexafffundvenue
Christina M. Davy, Michael E. Donaldson, Yessica Rico, Cori L. Lausen, Kathleen A. Dogantzis, Kyle Ritchie, Craig K. R. Willis, Douglas W. Burles, Thomas S. Jung, Scott McBurney, Allysia Park, Donald F. McAlpine, Karen J. Vanderwolf, Christopher J. Kyle

Notice bibliographique

RevueFACETS · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueBat Biology and Ecology Studies
Établissements canadiensCanadian Wildlife FederationUniversity of Prince Edward IslandWildlife Conservation Society CanadaUniversity of New BrunswickYukon Department of EnvironmentUniversity of WinnipegParks CanadaTrent UniversityMinistry of Natural Resources and Forestry
Organismes subventionnairesMuseum of the North, University of AlaskaCanadian Wildlife Health CooperativeGovernment of OntarioAlaska Department of Fish and GameCanadian Wildlife FederationHabitat Conservation Trust FoundationParks CanadaLiber Ero FoundationMassachusetts Department of Fish and Game
Mots-clésMyotis lucifugusBiologyGene flowPopulationRange (aeronautics)Biological dispersalRefugium (fishkeeping)Genetic structureEcologyGenetic variationZoologyGeneticsHabitatGeneDemography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The fungus that causes bat white-nose syndrome (WNS) recently leaped from eastern North America to the Pacific Coast. The pathogen’s spread is associated with the genetic population structure of a host ( Myotis lucifugus). To understand the fine-scale neutral and immunogenetic variation among northern populations of M. lucifugus, we sampled 1142 individuals across the species’ northern range. We used genotypes at 11 microsatellite loci to reveal the genetic structure of, and directional gene flow among, populations to predict the likely future spread of the pathogen in the northwest and to estimate effective population size ( N e ). We also pyrosequenced the DRB1-like exon 2 of the class II major histocompatibility complex (MHC) in 160 individuals to explore immunogenetic selection by WNS. We identified three major neutral genetic clusters: Eastern, Montane Cordillera (and adjacent sampling areas), and Haida Gwaii, with admixture at intermediate areas and significant substructure west of the prairies. Estimates of N e were unexpectedly low (289–16 000). Haida Gwaii may provide temporary refuge from WNS, but the western mountain ranges are not barriers to its dispersal in M. lucifugus and are unlikely to slow its spread. Our major histocompatibility complex (MHC) data suggest potential selection by WNS on the MHC, but gene duplication limited the immunogenetic analyses.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,126
Score d'incertitude au seuil0,981

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,219
Écart entre enseignants0,204 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2017
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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