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Enregistrement W2755202085 · doi:10.1093/ofid/ofx163.477

Lessons Learned from Pseudo-Oubreak of Legionella pneumophilia Serogroup 1 Infections

2017· article· en· W2755202085 sur OpenAlexaboutno aff
Andrew Wallace, Constance Jones, Kim Helsabeck, Melissa C. Morgan, Jeremy J Frens, Cynthia J. Snider

Notice bibliographique

RevueOpen Forum Infectious Diseases · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueLegionella and Acanthamoeba research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésLegionellaMedicineOutbreakLegionella pneumophilaTransmission (telecommunications)PneumoniaLegionnaires' diseaseQuarter (Canadian coin)Emergency medicineHealth careEnvironmental healthIntensive care medicinePediatricsInternal medicineVirology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Legionnaires disease (LD) has been increasingly identified in communities, as well as healthcare-associated outbreaks linked to contaminated water in hospitals. Since Legionella can be found in man-made water systems, hospitals are particularly vigilant to ensure patient safety and minimize risk for Legionella exposure. We report the investigation of marked increase in number of pneumonia cases due to Legionella pneumophila serogroup 1 over 12 month period concerning for community and possible healthcare-associated outbreak. We conducted a record review of each positive Legionella Urinary Antigen Enzyme Immunoassay (EIA) test to see if: a) case definition was met, b) risk factor for LD, c) identify common points of potential exposure, d) healthcare exposure in the last 14 days. Assessment of patient and risk for nosocomial transmission were discussed with local and state health departments. Discordance between test result and patient clinical picture led us to repeat testing on 10 patients and discuss with laboratory to reassess testing process. If case suggested nosocomial transmission, environmental and water sampling for Legionella species were collected. We reviewed calculated ratio results from plate readers. The percent of positive urine Legionella tests in 2015 was 0.57% and increased to 1.36% in 2016. This rate further increased to 6.48% in last quarter of 2016 after testing switched to a different lab with same EIA. Case review suggested a discordance of positive test result and clinical presentation starting in September. Of a total of 61 cases, 33 occurred late in the year over 10 week period. Mean age of patients was 68.5 years old. Twenty-one cases did not fit case definition and 11 patients were possible LD; these cases had “low positive” results on plate reader. The lab reviewed technique, plate washing, and plate reader calculations for the assay. Nine specimens were concurrently tested by a different lab with negative results, thus pointing to lab inconsistency. Several false positives were noted in patients that did not fit the clinical picture of LD with a “low positive” test result by ratio calculation. Due to this lab error and concern for missing a diagnosis, roughly 20 patients were unnecessarily prescribed antibiotics. All authors: No reported disclosures.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,006
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,036
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Étude de cas · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,029

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0060,036
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0040,007
Science ouverte0,0020,002
Intégrité de la recherche0,0040,005
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,041
Tête enseignante GPT0,344
Écart entre enseignants0,303 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeÉtude de cas
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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