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Enregistrement W2755411995 · doi:10.1177/1040638717732372

Multi-locus sequence typing of <i>Streptococcus equi</i> subspecies <i>zooepidemicus</i> strains isolated from cats

2017· article· en· W2755411995 sur OpenAlexaffabout
Ann P. Britton, Shlomo E. Blum, Carolyn Legge, Ken Sojonky, Erin Zabek

Notice bibliographique

RevueJournal of Veterinary Diagnostic Investigation · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueStreptococcal Infections and Treatments
Établissements canadiensMinistry of AgricultureUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesWellcome Trust
Mots-clésOutbreakCATSStreptococcus equiBiologyVirologyMicrobiologyTypingSubspeciesMedicineGeneticsBacteriaZoology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Streptococcus equi subspecies zooepidemicus ( S. zooepidemicus) causes outbreaks of fatal respiratory disease in dog shelters and fatal respiratory and neurologic disease in cat shelters. We conducted multi-locus sequence typing analysis on S. zooepidemicus isolates from 5 Canadian and 3 Israeli cats with severe respiratory and neurologic disease, plus 1 isolate from a clinically normal shelter cat. Our aim was to determine if feline outbreaks are clonal and whether there is commonality between feline and canine strains. ST363 was identified as the causative strain of a Canadian outbreak of S. zooepidemicus-linked disease, and is a double-locus variant of ST173, which was isolated from one of the Israeli cats. ST363 was also isolated from the clinically normal cat, indicative of the potential for enzootic infection in shelters. Strains within the ST173 clonal complex were responsible for 2 large canine outbreaks in the United States and the United Kingdom, as well as the death of 1 cat in the United States outbreak. ST215 was isolated from 2 cats in the Israeli outbreak, and is unrelated to the ST173 complex. We conclude that S. zooepidemicus outbreaks in cat shelters are clonal and that strains within the ST173 clonal complex are pathogenic for both dogs and cats.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,426
Score d'incertitude au seuil0,747

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,129
Tête enseignante GPT0,364
Écart entre enseignants0,235 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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