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Enregistrement W2755425737 · doi:10.5489/cuaj.4269

Accuracy of kidney cancer diagnosis and histological subtype within Canadian cancer registry data

2017· article· en· W2755425737 sur OpenAlexaffvenueabout
Jeffrey G. Himmelman, Jennifer Merrimen, Kara Matheson, Chris Theriault, Lori Wood

Notice bibliographique

RevueCanadian Urological Association Journal · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRenal cell carcinoma treatment
Établissements canadiensNova Scotia Health AuthorityDalhousie University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineCancer registryChromophobe cellPopulationNot Otherwise SpecifiedCohortCancerRenal cell carcinomaPathologicalNephrectomyMedical diagnosisRetrospective cohort studySurgical pathologyKidney cancerPathologyClear cellInternal medicineKidney

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

INTRODUCTION: Provincial/territorial cancer registries (PTCRs) are the mainstay for Canadian population-based cancer statistics. Each jurisdiction captures this data in a population-based registry, including the Nova Scotia Cancer Registry (NSCR). The goal of this study was to describe data from the NSCR regarding renal cell carcinoma (RCC) pathology subtype and method of diagnosis and compare it to the actual pathology reports to determine the accuracy of diagnosis and histological subtype assignment. METHODS: This retrospective analysis included patients diagnosed with RCC in the NSCR from 2006-2010 with an ICD-O-3 code C64.9 seen or treated in the largest NS health district. From the NSCR, method of diagnosis and pathological diagnosis was recorded. All diagnoses of non-clear-cell RCC (nonccRCC) from NSCR were compared to the actual pathology report for descriptive comparison and reasons for discordance. RESULTS: 723 patients make up the study cohort. 81.3% of patients were diagnosed by nephrectomy, 11.1% radiography, 6.9 % biopsy, and 0.7% autopsy. By NSCR data, 52.8% had clear-cell (ccRCC), 20.5% RCC not otherwise specified (NOS), 12.7% papillary, 4% chromophobe, and the rest had other nonccRCC subtypes. By pathology reports, 69.5% had clear-cell, 15% papillary, 5% chromophobe, only 2.7% RCC NOS. There was a discordance rate of 15.4% between NSCR data and diagnosis from pathology report. Reasons for discordance were not enough information by the pathologist in 45.5%, misinterpretation of report by data coder in 22.2%, and true coding error in 32.3%. CONCLUSIONS: When using PTCR for RCC incidence data, it is important to understand how the diagnosis is made, as not all are based on pathological confirmation; in this cohort 11% were based on radiology. One must also be aware that clear-cell and non-clear-cell subtypes may differ between the PTCR data and pathology reports. In this study, ccRCC made up 52.8% of the registry diagnoses, but increased to 69.6% on pathology report review. Use of synoptic reporting and ongoing education may improve accuracy of registry data.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,008
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,037
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,057
Score d'incertitude au seuil0,114

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0080,037
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0040,007
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,068
Tête enseignante GPT0,310
Écart entre enseignants0,243 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2017
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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