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Enregistrement W2755639783 · doi:10.1093/cid/cix836

Prevalence of Hypogammaglobulinemia in Adult Invasive Pneumococcal Disease

2017· article· en· W2755639783 sur OpenAlexafffundabout
Juthaporn Cowan, Thuy Linh, Sacha Desjardins, K. Ramotar, Vicente Corrales‐Medina

Notice bibliographique

RevueClinical Infectious Diseases · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePneumonia and Respiratory Infections
Établissements canadiensOttawa HospitalUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesOttawa Hospital Research Institute
Mots-clésHypogammaglobulinemiaMedicinePneumococcal diseaseStreptococcus pneumoniaePneumococcal infectionsImmunologyDiseaseIntensive care medicinePediatricsAntibodyInternal medicineMicrobiologyAntibiotics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Patients with humoral immune deficiency are susceptible to invasive pneumococcal disease (IPD). This study estimates the prevalence of underlying hypogammaglobulinemia in admitted IPD cases and examines whether IPD cases had received preventative treatment. Methods: All adult IPD cases (Streptococcus pneumoniae in blood or cerebrospinal fluid) admitted to The Ottawa Hospital (TOH) from January 2013 to December 2015 were identified through the Eastern Ontario Regional Laboratory. Documented clinical demographics, S. pneumoniae serotype, serum immunoglobulins measured previously or in convalescence, and vaccination status of the cases were collected retrospectively for descriptive analyses. Results: There were 134 IPD in 133 patients (47.4% male; mean age 63, standard deviation [SD] = 15.6 years) during a 3-year observation period. All-cause mortality rate was 22.6% over a mean follow-up time of 362, SD = 345 days. Fifty-seven patients (42.9%) had serum immunoglobulin levels measured. Eighteen were either found to have hypogammaglobulinemia in convalescence (8/18) or previously known to have hypogammaglobulinemia (10/18). None of the known hypogammaglobulinemic patients had received antibiotic prophylaxis and/or immunoglobulin replacement therapy within 4 months prior to IPD. The high and low estimates of prevalence of hypogammaglobulinemia were 31.6% (of all measured) and 13.5% (of all cases). Among 18 patients with hematological malignancies in our cohort, 13 had hypogammaglobulinemia. Many isolates were vaccine serotypes; however, only 8 had documented previous pneumococcal vaccination. Conclusions: IPD has high mortality, and hypogammaglobulinemia was present in at least 13.5% of IPD cases. Secondary hypogammaglobulinemia is especially common in cases with hematological malignancy and IPD.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,023
Score d'incertitude au seuil0,046

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,038
Tête enseignante GPT0,375
Écart entre enseignants0,336 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations16
Publié2017
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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