MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2755863018 · doi:10.1017/s0024282917000378

A hidden basidiolichen rediscovered:<i>Omphalina oreades</i>is a separate species in the genus<i>Lichenomphalia</i>(Basidiomycota:<i>Agaricales</i>:<i>Hygrophoraceae</i>)

2017· article· en· W2755863018 sur OpenAlexaffabout
Robert Lücking, R. Greg Thorn, Irja Saar, Michele D. Piercey‐Normore, Bibiana Moncada, Jennifer Doering, Henry Mann, Renée Lebeuf, Maria VOITK, Andrus Voitk

Notice bibliographique

RevueThe Lichenologist · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueMycorrhizal Fungi and Plant Interactions
Établissements canadiensGovernment of Newfoundland and LabradorMemorial University of NewfoundlandUniversity of ManitobaWestern University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBasidiumBiologyInternal transcribed spacerBotanyRibosomal DNACladeGenusGenBankBasidiomycotaRibosomal RNAZoologyTaxonomy (biology)PhylogeneticsGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Molecular studies have shown the type collection ofOmphalina oreadesto be conspecific with a small brown basidiolichen from the Appalachian range in Newfoundland, both with 4-spored basidia. Two sequences deposited in GenBank, originally identified asO. grisella, fell in the same clade. Sequences of the type collection ofOmphalia grisella, with 2-spored basidia, formed a sister clade together with two GenBank deposits, one identified asO. grisellaand the other asOmphalina velutina.Omphalina oreadesis recombined here asLichenomphalia oreadescomb. nov., and the species redescribed and illustrated. Sequences of the internal transcribed spacer regions of nuclear ribosomal DNA (ITS rDNA) from the algae associated with two collections ofL. oreadesfell within a highly supported clade with members of an undetermined species ofCoccomyxa. The most abundant algal ribosomal large subunit sequence from granules at the base of a different collection matched GenBank sequences identified asChloroidium ellipsoideum, which is probably either a free-living algal species or a partner to a species ofTrapeliopsis.The second most abundant sequence matchedCoccomyxa subellipsoideaand is the most likely photobiont ofL. oreades. Further studies are required to elucidate the relationship ofL. velutinato these taxa.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,041
Tête enseignante GPT0,262
Écart entre enseignants0,221 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueThe LichenologistMême sujetMycorrhizal Fungi and Plant InteractionsTravaux en français237 207