A hidden basidiolichen rediscovered:<i>Omphalina oreades</i>is a separate species in the genus<i>Lichenomphalia</i>(Basidiomycota:<i>Agaricales</i>:<i>Hygrophoraceae</i>)
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Molecular studies have shown the type collection ofOmphalina oreadesto be conspecific with a small brown basidiolichen from the Appalachian range in Newfoundland, both with 4-spored basidia. Two sequences deposited in GenBank, originally identified asO. grisella, fell in the same clade. Sequences of the type collection ofOmphalia grisella, with 2-spored basidia, formed a sister clade together with two GenBank deposits, one identified asO. grisellaand the other asOmphalina velutina.Omphalina oreadesis recombined here asLichenomphalia oreadescomb. nov., and the species redescribed and illustrated. Sequences of the internal transcribed spacer regions of nuclear ribosomal DNA (ITS rDNA) from the algae associated with two collections ofL. oreadesfell within a highly supported clade with members of an undetermined species ofCoccomyxa. The most abundant algal ribosomal large subunit sequence from granules at the base of a different collection matched GenBank sequences identified asChloroidium ellipsoideum, which is probably either a free-living algal species or a partner to a species ofTrapeliopsis.The second most abundant sequence matchedCoccomyxa subellipsoideaand is the most likely photobiont ofL. oreades. Further studies are required to elucidate the relationship ofL. velutinato these taxa.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».