Multi-locus sequence types of <i>Mycoplasma bovis</i> isolated from Ontario, Canada in the past three decades have a temporal distribution
Notice bibliographique
Résumé
A total of 217 Mycoplasma bovis isolates cultured from clinical cases in Ontario, Canada, over the past 30 y were selected to be characterized by a multi-locus sequence typing (MLST) method. Eleven housekeeping genes were evaluated for suitability for MLST; 2 loci that had been used in prior MLST schemes, dnaN and metS, along with hsp70 were chosen for further sequence analysis. The remaining loci- adk, efp, gmk, gyrB, polC, rpoB, tpiA, and uvrC genes-were not used because they had little to no sequence variation. The sequence data from the chosen loci ( dnaN, hsp70, metS) generated 28 sequence types (STs), with the 3 loci having 15, 5, and 7 alleles, respectively. These molecular typing results revealed that the STs had a temporal distribution; over the course of 3 decades, some STs disappeared and new STs appeared. Recent isolates had a greater variety of STs, which may indicate that new strains are emerging more rapidly now than in the past.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».