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Enregistrement W2756138208 · doi:10.1104/pp.17.01042

Nitric Oxide Mediates Nitrite-Sensing and Acclimation and Triggers a Remodeling of Lipids

2017· article· en· W2756138208 sur OpenAlexafffund
Lina-Juana Dolch, Josselin Lupette, Guillaume Tourcier, Mariette Bedhomme, Séverine Collin, Leonardo Magneschi, Melissa Conte, Khawla Seddiki, Christelle Richard, Erwan Corre, Laurent Fourage, Frédéric Laeuffer, Robert C. Richards, Michael Reith, Fabrice Rébeillé, Juliette Jouhet, Patrick J. McGinn, Éric Maréchal

Notice bibliographique

RevuePLANT PHYSIOLOGY · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineEarth and Planetary Sciences
ThématiqueMarine and coastal ecosystems
Établissements canadiensNational Research Council Canada
Organismes subventionnairesNational Research Council CanadaAgence Nationale de la Recherche
Mots-clésPhaeodactylum tricornutumNitrite reductaseBiochemistryNitric oxideNitrate reductaseNitriteChemistryBiologyCell biologyNitrateEnzymeBotanyAlgae

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Nitric oxide (NO) is an intermediate of the nitrogen cycle, an industrial pollutant, and a marker of climate change. NO also acts as a gaseous transmitter in a variety of biological processes. The impact of environmental NO needs to be addressed. In diatoms, a dominant phylum in phytoplankton, NO was reported to mediate programmed cell death in response to diatom-derived polyunsaturated aldehydes. Here, using the Phaeodactylum Pt1 strain, 2E,4E-decadienal supplied in the micromolar concentration range led to a nonspecific cell toxicity. We reexamined NO biosynthesis and response in Phaeodactylum. NO inhibits cell growth and triggers triacylglycerol (TAG) accumulation. Feeding experiments indicate that NO is not produced from Arg but via conversion of nitrite by the nitrate reductase. Genome-wide transcriptional analysis shows that NO up-regulates the expression of the plastid nitrite reductase and genes involved in the subsequent incorporation of ammonium into amino acids, via both Gln synthesis and Orn-urea pathway. The phosphoenolpyruvate dehydrogenase complex is also up-regulated, leading to the production of acetyl-CoA, which can feed TAG accumulation upon exposure to NO. Transcriptional reprogramming leading to higher TAG content is balanced with a decrease of monogalactosyldiacylglycerol (MGDG) in the plastid via posttranslational inhibition of MGDG synthase enzymatic activity by NO. Intracellular and transient NO emission acts therefore at the basis of a nitrite-sensing and acclimating system, whereas a long exposure to NO can additionally induce a redirection of carbon to neutral lipids and a stress response.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,212
Écart entre enseignants0,192 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations40
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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