The distribution of active β-glucosidase-producing microbial communities in composting
Notice bibliographique
Résumé
The composting ecosystem is a suitable source for the discovery of novel microorganisms and secondary metabolites. Cellulose degradation is an important part of the global carbon cycle, and β-glucosidases complete the final step of cellulose hydrolysis by converting cellobiose to glucose. This work analyzes the succession of β-glucosidase-producing microbial communities that persist throughout cattle manure - rice straw composting, and evaluates their metabolic activities and community advantage during the various phases of composting. Fungal and bacterial β-glucosidase genes belonging to glycoside hydrolase families 1 and 3 (GH1 and GH3) amplified from DNA were classified and gene abundance levels were analyzed. The major reservoirs of β-glucosidase genes were the fungal phylum Ascomycota and the bacterial phyla Firmicutes, Actinobacteria, Proteobacteria, and Deinococcus-Thermus. This indicates that a diverse microbial community utilizes cellobiose. The succession of dominant bacteria was also detected during composting. Firmicutes was the dominant bacteria in the thermophilic phase of composting; there was a shift to Actinomycetes in the maturing stage. Proteobacteria accounted for the highest proportions during the heating and thermophilic phases of composting. By contrast, the fungal phylum Ascomycota was a minor microbial community constituent in thermophilic phase of composting. Combined with the analysis of the temperature, cellulose degradation rate and the carboxymethyl cellulase and β-glucosidase activities showed that the bacterial GH1 family β-glucosidase genes make greater contribution in cellulose degradation at the later thermophilic stage of composting. In summary, even GH1 bacteria families β-glucosidase genes showing low abundance in DNA may be functionally important in the later thermophilic phase of composting. The results indicate that a complex community of bacteria and fungi expresses β-glucosidases in compost. Several β-glucosidase-producing bacteria and fungi identified in this study may represent potential indicators of composting in cellulose degradation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».