Epidemiology and Clinical Outcomes of Respiratory Viral Infections at a Single Tertiary Centre in Alberta, Canada
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background Respiratory viral infections (RVI) are commonly seen in hospitalized patients. While many studies have examined outcomes with influenza, fewer studies have examined outcomes of community and hospital acquired infections of other respiratory viruses. Methods Data were prospectively collected from adult (age>17 years) inpatients with a positive result from respiratory viral multiplex panel testing during consecutive viral respiratory seasons from November 2014 to April 2017 at our facility. Ambulatory patients were excluded. Clinical outcomes including ICU admission requiring intubation, overall mortality and respiratory virus infection-related mortality was assessed at 30 days post infection. Results A total of 731 inpatients with positive results were identified. Influenza A was the most commonly detected virus (44%) followed by respiratory syncytial virus (RSV)(14%) and rhinovirus/enterovirus (13%). Rates of RSV and human metapneumovirus infections displayed significant yearly variability. There were no significant differences in rates of ICU admission requiring intubation (16.8% vs. 14.3% P = 0.35) between infections caused by influenza A and B and other respiratory viruses. In addition, mortality related to respiratory infections between these groups was also similar (5.7% Influenza vs. 4.5% non-Influenza P = 0.46). Ninety-five (15%) of identified patients had hospital acquired respiratory viral infections. Influenza A was the most commonly isolated hospital acquired infection (39%). Rates of ICU admission requiring intubation (22.6% vs. 14.6%, P = 0.06) and respiratory infection-related mortality (7.4% vs. 4.8%, P = 0.14) were higher in hospital acquired RVI but did not meet statistical significance. Less than half (45%) of all patients testing positive for influenza received antiviral treatment (oseltamivir). Respiratory infection-related mortality was not significantly different between those who were treated and those who were not treated (5.5% vs. 4.4%, P = 0.64). Conclusion While influenza remains the most common community and hospital acquired respiratory viral infection in inpatients at our facility, half of infections were attributed to other respiratory viruses and these resulted in similar rates of serious outcomes including ICU admission and mortality. Disclosures All authors: No reported disclosures.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,004 |
| Études des sciences et des technologies | 0,003 | 0,001 |
| Communication savante | 0,002 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».