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Enregistrement W2756820512 · doi:10.1038/s41598-017-12762-0

Characterization of a putative Plasmodium falciparum SAC1 phosphoinositide-phosphatase homologue potentially required for survival during the asexual erythrocytic stages

2017· article· en· W2756820512 sur OpenAlexafffund
Catherine Thériault, Dave Richard

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTrypanosoma species research and implications
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Institutes of HealthCanadian Blood Services
Mots-clésBiologyCytokinesisPlasmodium (life cycle)Plasmodium falciparumCell biologyKinasePhosphataseEndoplasmic reticulumMalariaGeneticsPhosphorylationCell divisionImmunologyCellParasite hosting

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Despite marked reductions in morbidity and mortality in the last ten years, malaria still takes a tremendous toll on human populations throughout tropical and sub-tropical regions of the world. The absence of an effective vaccine and resistance to most antimalarial drugs available demonstrate the urgent need for new intervention strategies. Phosphoinositides are a class of lipids with critical roles in numerous processes and their specific subcellular distribution, generated through the action of kinases and phosphatases, define organelle identity in a wide range of eukaryotic cells. Recent studies have highlighted important functions of phosphoinositide kinases in several parts of the Plasmodium lifecycle such as hemoglobin endocytosis and cytokinesis during the erythrocytic stage however, nothing is known with regards to the parasite's putative phosphoinositide phosphatases. We present the identification and initial characterization of a putative homologue of the SAC1 phosphoinositide phosphatase family. Our results show that the protein is expressed throughout the asexual blood stages and that it localises to the endoplasmic reticulum and potentially to the Golgi apparatus. Furthermore, conditional knockdown and knockout studies suggest that a minimal amount of the protein are likely required for survival during the erythrocytic cycle.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,036
Tête enseignante GPT0,322
Écart entre enseignants0,286 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations19
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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