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Enregistrement W2756896347 · doi:10.1093/ofid/ofx166

Seasonal Influenza Forecasting in Real Time Using the Incidence Decay With Exponential Adjustment Model

2017· article· en· W2756896347 sur OpenAlexaffabout
Tahmina Nasserie, Ashleigh R. Tuite, Lindsay Whitmore, Todd F. Hatchette, Steven J. Drews, Adriana Peci, Jeffrey C. Kwong, Dara Spatz Friedman, Gary Garber, Jonathan B. Gubbay, David N. Fisman

Notice bibliographique

RevueOpen Forum Infectious Diseases · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueInfluenza Virus Research Studies
Établissements canadiensSunnybrook HospitalPublic Health OntarioProvincial Laboratory of Public HealthUniversity of AlbertaAlberta Health ServicesCapital District Health AuthorityNova Scotia Health AuthorityUniversity of TorontoDalhousie UniversityOttawa Public HealthSt. Michael's Hospital
Organismes subventionnairesPfizer
Mots-clésMedicineIncidence (geometry)Seasonal influenzaExponential growthExponential decayExponential functionCoronavirus disease 2019 (COVID-19)Internal medicineMathematicsNuclear physicsInfectious disease (medical specialty)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Seasonal influenza epidemics occur frequently. Rapid characterization of seasonal dynamics and forecasting of epidemic peaks and final sizes could help support real-time decision-making related to vaccination and other control measures. Real-time forecasting remains challenging. METHODS: We used the previously described "incidence decay with exponential adjustment" (IDEA) model, a 2-parameter phenomenological model, to evaluate the characteristics of the 2015-2016 influenza season in 4 Canadian jurisdictions: the Provinces of Alberta, Nova Scotia and Ontario, and the City of Ottawa. Model fits were updated weekly with receipt of incident virologically confirmed case counts. Best-fit models were used to project seasonal influenza peaks and epidemic final sizes. RESULTS: estimates were generated in Nova Scotia and Ottawa. Final size projections that made use of complete time series were accurate to within 6% of true final sizes, but final size was using pre-peak data. Projections of epidemic peaks stabilized before the true epidemic peak, but these were persistently early (~2 weeks) relative to the true peak. CONCLUSIONS: A simple, 2-parameter influenza model provided reasonably accurate real-time projections of influenza seasonal dynamics in an atypically late, mild influenza season. Challenges are similar to those seen with more complex forecasting methodologies. Future work includes identification of seasonal characteristics associated with variability in model performance.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,005
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,286
Score d'incertitude au seuil0,569

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,005
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,110
Tête enseignante GPT0,395
Écart entre enseignants0,285 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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