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Enregistrement W2757115775 · doi:10.1373/clinchem.2017.278457

Short-Term Stabilities of 21 Amino Acids in Dried Blood Spots

2017· letter· en· W2757115775 sur OpenAlexafffund
Jun Han, Rehan Higgins, Mark D. Lim, Karen Lin, Juncong Yang, Christoph H. Borchers

Notice bibliographique

RevueClinical Chemistry · 2017
Typeletter
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolism and Genetic Disorders
Établissements canadiensMcGill UniversityJewish General HospitalGenome British ColumbiaUniversity of Victoria
Organismes subventionnairesGenome AlbertaLeading Edge Endowment FundJewish General HospitalGenome British ColumbiaGenome CanadaBill and Melinda Gates Foundation
Mots-clésTrifluoroacetic acidDried blood spotDried bloodChromatographyChemistryElectrospray ionizationAmino acidNewborn screeningMass spectrometryAcetonitrileSpotsSample preparationBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

To the Editor: Dried blood spot (DBS)1 sampling is used in disease diagnosis, epidemiological surveillance, and newborn screening, and enables sample collection far from analytical laboratories and shipment via mail services. Amino acids (AAs) measured in DBS are routinely used for the diagnosis of inborn errors of metabolism (1) and childhood malnutrition (2), but environmental stresses incurred during sampling, transportation, and storage can impact the short-term (3) and long-term (4) stabilities of some AAs. Here, we systematically investigated the stabilities of 21 routinely analyzed AAs in DBS under environmental conditions simulating a global health work flow. DBSs were prepared by precisely blotting 30 μL of whole blood onto cellulose-based Whatman 903, FTA DMPK-C, and cotton-based PerkinElmer 226 cards. The optimized sample preparation used 200 μL of 0.02% trifluoroacetic acid in water to completely resuspend the entire DBS spot, followed by ultrasonic extraction with 800 μL of methanol/acetonitrile (1:1, v/v) containing 0.02% trifluoroacetic acid. The AAs were dansylated (5) at pH 9.2 and analyzed by C18 reversed-phase liquid chromatography/positive electrospray ionization/multiple-reaction monitoring mass spectrometry, with 21 13C- or 2H-labeled internal standards, for precise measurements of their molar concentrations (CVs ≤ 7.9% and recoveries of 88.4%–112.8%). Four sets of stability-testing experiments were conducted, and the molar concentrations of each AA were measured from 4 biological replicates of each DBS set. Stabilities were expressed as percentages of the measured AA concentrations in control DBSs that had been stored in the dark at −80 °C.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,012
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,018

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,012
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0030,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,033
Tête enseignante GPT0,327
Écart entre enseignants0,294 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations34
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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