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Enregistrement W2757136805 · doi:10.1080/15592324.2017.1382795

Farnesylation-mediated subcellular localization is required for CYP85A2 function

2017· article· en· W2757136805 sur OpenAlexaff
Muhammad Jamshed, Siyu Liang, Neil M.N. Hickerson, Marcus A. Samuel

Notice bibliographique

RevuePlant Signaling & Behavior · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Molecular Biology Research
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPrenylationBiologyCell biologyEndomembrane systemGeranylgeranylationBiochemistrySubcellular localizationEndoplasmic reticulumBrassinosteroidFarnesyltransferaseArabidopsisGolgi apparatusEnzymeGeneMutant

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Protein farnesylation refers to the addition of a 15-carbon farnesyl isoprenoid to the cysteine residue of the CaaX motif at the carboxy terminus of target proteins. In spite of its known roles in plant development and abiotic stress tolerance, how these processes are precisely regulated by farnesylation had remained elusive. We recently showed that CYP85A2, the cytochrome P450, which converts castasterone to brassinolide in the last step of brassinosteroid synthesis must be farnesylated in order to function in this pathway. Lack of either CYP85A2 or the farnesylation motif of CYP85A2 resulted in reduced brassinolide accumulation, hypersensitivity to ABA, and increased plant drought tolerance. In this study, we have assessed the influence of the N-terminal secretory signal and the C-terminal CaaX motif of CYP85A2 in mediating CYP85A2 function and targeting to endomembrane compartments. We show that CaaX motif could still target CYPA85A2 in the absence of an intact N-terminal secretory signal to the respective membrane compartments and partially rescue cyp85a2-2 phenotypes. However, in the absence of both the CaaX motif and the secretory signal, CYP85A2 is not targeted to the membranes and becomes unstable.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,464
Score d'incertitude au seuil0,728

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,055
Tête enseignante GPT0,273
Écart entre enseignants0,218 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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