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Enregistrement W2757293228 · doi:10.1101/192625

Two <i>rsaM</i> homologues encode central regulatory elements modulating quorum sensing expression in <i>Burkholderia thailandensis</i>

2017· preprint· en· W2757293228 sur OpenAlexaff
Servane Le Guillouzer, Marie‐Christine Groleau, Éric Déziel

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2017
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial biofilms and quorum sensing
Établissements canadiensInstitut National de la Recherche Scientifique
Organismes subventionnairesUniversity of Washington
Mots-clésQuorum sensingHomoserineBurkholderiaBiologyGeneBiosynthesisGene clusterGeneticsMicrobiologyBacteriaVirulence

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The bacterium Burkholderia thailandensis possesses three conserved N -acyl- L -homoserine lactone (AHL) quorum sensing (QS) systems designated BtaI1/BtaR1 (QS-1), BtaI2/BtaR2 (QS-2), and BtaI3/BtaR3 (QS-3). These QS-systems are associated with the biosynthesis of N -octanoyl-homoserine lactone (C 8 -HSL), N -3-hydroxy-decanoyl-homoserine lactone (3OHC10-HSL), as well as N -3-hydroxy-octanoyl-homoserine lactone (3OHC 8 -HSL), which are produced by the LuxI-type synthase BtaI1, BtaI2, and BtaI3, and modulated by the LuxR-type transcriptional regulators BtaR1, BtaR2, and BtaR3. Both btaR1 / btaI1 and btaR2 / btaI2 gene clusters contain an additional gene that is conserved in the Burkholderia genus, homologous to a gene coding for the negative AHL biosynthesis modulatory protein RsaM originally identified in the phytopathogen Pseudomonas fuscovaginae , and hence designated rsaM1 and rsaM2 . We have characterized the function of these two rsaM homologues and demonstrated their involvement in the regulation of AHLs biosynthesis in B. thailandensis strain E264. We measured the production of C 8 -HSL, 3OHC 10 -HSL, and 3OHC 8 -HSL by liquid chromatography coupled to tandem mass spectrometry (LC-MS/MS) in the wild-type strain and in the rsaM 1 - and rsaM 2 - mutants, and monitored the transcription of btaI 1, btaI 2, and btaI 3 using chromosomal mini-CTX- lux transcriptional reporters. The expression of btaR 1, btaR 2, and btaR 3 was also measured by quantitative everse-transcription PCR (qRT-PCR). We demonstrate that the QS-1 system is repressed by RsaM1, whereas RsaM2 principally represses the QS-2 system. We also found that both rsaM1 and rsaM2 are QS-controlled, as well as negatively auto-regulated. We conclude that RsaM1 and RsaM2 are an integral part of the QS modulatory circuitry of B. thailandensis , and play a major role in the hierarchical and homeostatic organization of the QS-1, QS-2, and QS-3 systems. Importance Quorum sensing (QS) is a global regulatory mechanism of genes expression depending on bacterial density. QS is commonly involved in the coordination of genes expression associated with the establishment of host-pathogen interactions and acclimatization to the environment. We present the functional characterization of the two rsaM homologues designated rsaM1 and rsaM2 in the regulation of the multiple QS systems coexisting in the non-pathogenic bacterium Burkholderia thailandensis , widely used as a model system for the study of the pathogen Burkholderia pseudomallei . We found that inactivation of these rsaM homologues, which are clustered with the other QS genes, profoundly affects the QS regulatory circuity of B. thailandensis . It is proposed that these genes code for QS repressors and we conclude that they constitute essential regulatory components of the QS modulatory network of B. thailandensis , and provide additional layers of regulation to modulate the expression of QS-controlled genes, including those encoding virulence/survival factors and linked to environmental adaptation in B. pseudomallei .

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,230
Écart entre enseignants0,218 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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