MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2757818999

Tracking a Deadly VirusHIGHLY PATHOGENIC AVIAN INFLUENZA IN WILD BIRDS

2016· article· en· W2757818999 sur OpenAlexaboutno aff
Tom Deliberto, Gail Keirn

Notice bibliographique

RevueLincoln (University of Nebraska) · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Virus Research Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésInfluenza A virus subtype H5N1Highly pathogenicWaterfowlBiologyPandemicVirologyZoologyGeographyCoronavirus disease 2019 (COVID-19)MedicineEcologyVirusInfectious disease (medical specialty)Disease
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

For Dennis Kohler, the call was somewhat unexpected. On a cold, windy morning in December 2014, Kohler sat in his Colorado office reviewing research plans for upcoming disease studies. A few hours later, Koehler's colleagues at the National Wildlife Health Center in Madison, Wis., called to notify him and other members of the U.S. Department of Agriculture's National Wildlife Disease Program (NWDP) that recent samples collected from wild birds in Washington State had tested positive for highly pathogenic avian influenza (HPAI). Earlier that month, a die-off of mallards (Anas platyrhynchos), American wigeon (A. Americana) and northern pintails (A. acuta) had occurred on Wiser Lake in Whatcom County, Wash., just south of the Canadian border near the site of HP AI outbreaks in British Columbia. State biologists had collected samples for testing, and the analysis revealed the birds likely died of aspergillosis, a common fungal infection. But what was worrisome is that they also tested positive for the Eurasian HS avian influenza virus, marking the first time a highly pathogenic Eurasian strain of avian influenza had been detected in the United States (Ip et al. 201S). Kohler knew an outbreak of HP AI in domestic turkey and chicken flocks in Canada had led the state to conduct enhanced surveillance but was still a little surprised to learn that HP AI had been discovered in wild birds. The NWDP had been monitoring and preparing for HPAI in wild birds since the 200S HPAI HSN1 scare in Southeast Asia that caused officials to kill hundreds of thousands of domestic poultry. Now the virus was confirmed in the U.S. and Kohler needed to mobilize a team of expelts to respond.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,026
Score d'incertitude au seuil0,052

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,039
Tête enseignante GPT0,236
Écart entre enseignants0,196 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueLincoln (University of Nebraska)Même sujetPlant Virus Research StudiesTravaux en français237 207