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Enregistrement W2757845778 · doi:10.1038/s41598-017-12903-5

Genetic connection between cell-wall composition and grain yield via parallel QTL analysis in indica and japonica subspecies

2017· article· en· W2757845778 sur OpenAlexfundno aff
Zuopeng Xu, Shance Li, Changquan Zhang, Baocai Zhang, Kong-zhi ZHU, Yihua Zhou, Qiaoquan Liu

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Mapping and Diversity in Plants and Animals
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesPriority Academic Program Development of Jiangsu Higher Education InstitutionsInstitute of Genetics and Developmental Biology, Chinese Academy of SciencesChinese Academy of SciencesInstitute of GeneticsNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésQuantitative trait locusJaponicaBiologyCultivarGeneticsBotanyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Grain yield is a complicated trait, which is highly associated with biomass productivity. The cell wall is a central element of biomass, and its biogenesis contributes to plant architecture and development. However, the genetic link between cell-wall property and grain yield is largely unclear. Here, we report on identification of quantitative trait loci (QTLs) for grain yield-related traits and cell-wall composition with a set of chromosomal segment substitution lines (CSSLs) that were generated by using 9311, an indica cultivar as donor, and Nipponbare, a japonica cultivar as recipient. Nipponbare and 9311 showed significant differences in grain yield-related traits and cell-wall composition. Genotyping with molecular markers, 125 lines covering 95.6% of the whole genome of 9311 were employed for phenotypic and chemical examinations. Thirty-seven QTLs for grain yield-related traits and nineteen QTLs for cell-wall composition have been identified. In addition to correlation analysis, we found overlapped and closely linked QTLs for two sets of traits. Fine-mapping further narrowed a QTL for cellulose content together with HD17, a known QTL for heading date and grain yield, suggesting that plants may regulate cell wall biogenesis and grain yield via related means. Our study provided genetic clues for cloning QTLs for both complicated traits.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,233
Écart entre enseignants0,217 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations16
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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