Enumerating viable phytoplankton using a culture-based Most Probable Number assay following ultraviolet-C treatment
Notice bibliographique
Résumé
Ballast water management systems (BWMS) must be tested to assess their compliance with standards for the discharge of organisms, for example in the ≥ 10- and < 50-μm size category, which is dominated by phytoplankton. Assessment of BWMS performance with the vital stains fluorescein diacetate + 5-chlorofluorescein diacetate, required by regulations in the USA, is problematic in the case of ultraviolet-C (UVC) radiation. This is because UVC targets nucleotides-and thus reproduction, hence viability-rather than membrane integrity, which is assayed by the stains. The Serial Dilution Culture-Most Probable Number (SDC-MPN) method, long used to enumerate fragile phytoplankton from natural communities, is appropriate for counting viable phytoplankton. We developed QA/QC "best practice" criteria for its application as a robust and repeatable assay of viable cells in cultures of phytoplankton before and after experimental treatment, then constructed dose-response curves for UVC-induced loss of viable cells in 12 species of phytoplankton from seven divisions. Sensitivity to UVC, expressed as the dose required to reduce viability by 99%-the criterion for type approval of treatment systems-varied more than 10-fold and was not correlated with cell size. The form of the dose-response curves varied between taxa, with most having a threshold dose below which there was no reduction in viability. Analysis of the patterns of growth indicates that if recovery from treatment occurred, it was complete in 1 or 2 days in > 80% of cases, long before the assays were terminated. We conclude that the SDC-MPN assay as described is robust and adaptable for use on natural phytoplankton.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,003 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».