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Enregistrement W2759028180 · doi:10.5599/admet.5.3.394

The tales of two organic cation transporters, OCT-1 and OCT-2, in C. elegans

2017· article· en· W2759028180 sur OpenAlexaff
Dindial Ramotar

Notice bibliographique

RevueADMET & DMPK · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetics, Aging, and Longevity in Model Organisms
Établissements canadiensUniversité de MontréalHôpital Maisonneuve-Rosemont
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCaenorhabditis elegansTransporterDownregulation and upregulationPhenotypeMutantBiologyOrganic cation transport proteinsSolute carrier familyCell biologyChemistryGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Solute carrier transporters, previously thought to perform roles in the transport of ions and various nutrients are now assigned broader functions. These transporters have recently been shown to permit entry of therapeutic drugs into cells. There is growing interest to understand the broad spectrum of drugs and chemical compounds that are recognized by these transporters such that specific ligands can be used as therapeutics to target definite physiological pathways. To facilitate this investigation, simpler and cost effective model systems are needed, one of such is the live whole model animal Caenorhabditis elegans (C. elegans) that offers a multitude of advantages. In general, studies with C. elegans are feasible due to the simplicity of the readouts that include lifespan, brood size, germ cell death, and visualization by epifluorescent microscopy, which can be set up in any laboratory. In C. elegans, two solute carrier transporters, the organic cation transporters OCT-1 and its paralogue OCT-2 have been partially characterized. OCT-1 mutants display a significantly reduced lifespan and brood size, as well as exhibiting an increased susceptibility towards oxidative stress and a subset of DNA damaging agents. These multiple phenotypes are directly linked to OCT-1 depletion causing upregulation of OCT-2, as RNAi-mediated downregulation of OCT-2 rescues the oct-1 mutant phenotypes. Thus, in C. elegans OCT-1 exerts control onto OCT-2, and this latter transporter plays a predominant role in the uptake of various ligands. We first showed that OCT-2 can efficiently mediate uptake of the widely used anticancer drug doxorubicin into the animals, but prevented uptake upon its downregulation. Additional ligands of OCT-2 including cisplatin and camptothecin were revealed by ligand-docking prediction studies. These analyses generated docking scores indicating that OCT-2 can make robust contact with a number of therapeutics and anticancer drugs, as well as chemical compounds that possess the ability to target specific physiological pathways. Several of the compounds displaying high docking scores with OCT-2 were validated and indeed found to be substrates that OCT-2 transported into the animals. This review provides an insight how the transporters OCT-1 and OCT-2 of a simple model organism C. elegans can be exploited to report on the cytotoxicities and genotoxicities of therapeutic agents, as well as trace amounts of undocumented toxic compounds with neoplastic potentials that are present in the environment.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,233
Score d'incertitude au seuil0,353

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,259
Écart entre enseignants0,251 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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