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Enregistrement W2759404744 · doi:10.1002/mnfr.201700347

Genome‐Wide Interactions with Dairy Intake for Body Mass Index in Adults of European Descent

2017· review· en· W2759404744 sur OpenAlexaff
Caren E. Smith, Jack L. Follis, Hassan S. Dashti, Toshiko Tanaka, Mariaelisa Graff, Amanda M. Fretts, Tuomas O. Kilpeläinen, Mary K. Wojczynski, Kris Richardson, Mike A. Nalls, Christina‐Alexandra Schulz, Ching‐Ti Liu, Alexis C. Wood, Esther Winters-van Eekelen, Carol A. Wang, Paul S. de Vries, Vera Mikkilä, Rebecca Rohde, Bruce M. Psaty, Torben Hansen, Mary F. Feitosa, Chao‐Qiang Lai, Denise K. Houston, Luigi Ferruci, Ulrika Ericson, Zhe Wang, Renée de Mutsert, Wendy H. Oddy, Ilkka Seppälä, Anne E. Justice, Rozenn N. Lemaître, Thorkild I. A. Sørensen, Michael A. Province, Laurence D. Parnell, Melissa E. Garcia, Stefania Bandinelli, Marju Orho‐Melander, Stephen S. Rich, Frits R. Rosendaal, Craig E. Pennell, Jessica C. Kiefte–de Jong, Mika Kähönen, Kristin L. Young, Oluf Pedersen, Stella Aslibekyan, Jerome I. Rotter, Dennis O. Mook‐Kanamori, M. Carola Zillikens, Olli T. Raitakari, Kari E. North, Kim Overvad, Donna K. Arnett, Albert Hofman, Terho Lehtimäki, Anne Tjønneland, André G. Uitterlinden, Fernando Rivadeneira, Oscar H. Franco, J. Bruce German, David S. Siscovick, L. Adrienne Cupples, José M. Ordovás

Notice bibliographique

RevueMolecular Nutrition & Food Research · 2017
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDigestive system and related health
Établissements canadiensInstitute of Aging
Organismes subventionnairesNational Center for Advancing Translational SciencesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNational Heart, Lung, and Blood Institute
Mots-clésBody mass indexDescent (aeronautics)GenomeIndex (typography)Genome-wide association studyBiologyGeneticsFood scienceEndocrinologyGeographyGenotypeGeneSingle-nucleotide polymorphismComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Scope Body weight responds variably to the intake of dairy foods. Genetic variation may contribute to inter‐individual variability in associations between body weight and dairy consumption. Methods and results A genome‐wide interaction study to discover genetic variants that account for variation in BMI in the context of low‐fat, high‐fat and total dairy intake in cross‐sectional analysis was conducted. Data from nine discovery studies (up to 25 513 European descent individuals) were meta‐analyzed. Twenty‐six genetic variants reached the selected significance threshold (p‐interaction <10−7), and six independent variants (LINC01512‐rs7751666, PALM2/AKAP2‐rs914359, ACTA2‐rs1388, PPP1R12A‐rs7961195, LINC00333‐rs9635058, AC098847.1‐rs1791355) were evaluated meta‐analytically for replication of interaction in up to 17 675 individuals. Variant rs9635058 (128 kb 3’ of LINC00333) was replicated (p‐interaction = 0.004). In the discovery cohorts, rs9635058 interacted with dairy (p‐interaction = 7.36 × 10−8) such that each serving of low‐fat dairy was associated with 0.225 kg m−2 lower BMI per each additional copy of the effect allele (A). A second genetic variant (ACTA2‐rs1388) approached interaction replication significance for low‐fat dairy exposure. Conclusion Body weight responses to dairy intake may be modified by genotype, in that greater dairy intake may protect a genetic subgroup from higher body weight.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,007
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,021

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,007
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,008
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,104
Tête enseignante GPT0,414
Écart entre enseignants0,310 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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