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Enregistrement W2759422303 · doi:10.1107/s205979831701333x

Structure of the conserved<i>Francisella</i>virulence protein FvfA

2017· article· en· W2759422303 sur OpenAlexaff
Subramania Kolappan, K.Y. Lo, Chiao Ling Jennifer Shen, Julian A. Guttman, Lisa Craig

Notice bibliographique

RevueActa Crystallographica Section D Structural Biology · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacillus and Francisella bacterial research
Établissements canadiensSimon Fraser University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésFrancisella tularensisFrancisellaPeriplasmic spaceVirulenceBiologyMicrobiologyBacteriaBacterial outer membraneEscherichia coliCell biologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Francisella tularensis is a potent human pathogen that invades and survives in macrophage and epithelial cells. Two identical proteins, FTT_0924 from F. tularensis subsp. tularensis and FTL_1286 from F. tularensis subsp. holarctica LVS, have previously been identified as playing a role in protection of the bacteria from osmotic shock and its survival in macrophages. FTT_0924 has been shown to localize to the inner membrane, with its C-terminus exposed to the periplasm. Here, crystal structures of the F. novicida homologue FTN_0802, which we call FvfA, in two crystal forms are reported at 1.8 Å resolution. FvfA differs from FTT_0924 and FTL_1286 by a single amino acid. FvfA has a DUF1471 fold that closely resembles the Escherichia coli outer membrane lipoprotein RscF, a component of a phosphorelay pathway involved in protecting bacteria from outer membrane perturbation. The structural and functional similarities and differences between these proteins and their implications for F. tularensis pathogenesis are discussed.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,354
Score d'incertitude au seuil0,639

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,256
Écart entre enseignants0,246 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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