Structure of the conserved<i>Francisella</i>virulence protein FvfA
Notice bibliographique
Résumé
Francisella tularensis is a potent human pathogen that invades and survives in macrophage and epithelial cells. Two identical proteins, FTT_0924 from F. tularensis subsp. tularensis and FTL_1286 from F. tularensis subsp. holarctica LVS, have previously been identified as playing a role in protection of the bacteria from osmotic shock and its survival in macrophages. FTT_0924 has been shown to localize to the inner membrane, with its C-terminus exposed to the periplasm. Here, crystal structures of the F. novicida homologue FTN_0802, which we call FvfA, in two crystal forms are reported at 1.8 Å resolution. FvfA differs from FTT_0924 and FTL_1286 by a single amino acid. FvfA has a DUF1471 fold that closely resembles the Escherichia coli outer membrane lipoprotein RscF, a component of a phosphorelay pathway involved in protecting bacteria from outer membrane perturbation. The structural and functional similarities and differences between these proteins and their implications for F. tularensis pathogenesis are discussed.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».