Epigenetic inactivation to target the arginine biosynthetic pathway in multiple myeloma.
Notice bibliographique
Résumé
e18567 Background: Argininoosuccinate synthetase-1 (ASS1) catalyses the rate-limiting step in arginine biosynthesis, the conversion of citruline to arginine. Argininosuccinate lyase (ASL) is an enzyme that catalyses the reversible breakdown of arginosuccinate producing arginine and fumerate. Arginine deprivation using arginine deiminase (ADI-PEG20) is currently considered as a novel therapeutic intervention for cancer. In this perspective, we investigated the methylation status of the ASS1 and ASL CpG islands in multiple myeloma (MM) and analyzed for clinical relevance. Methods: Genomic DNA was extracted from bone marrow aspirate samples from 46 MM patients (28 male, 18 female, median age 64 years) obtained at diagnosis. Methylation-specific PCR was employed to study the methylation in the ASS1 and ASL CpG islands. DNA was isolated and bisulphite modified using commercially available kits. Logistic regression analyses were used to measure the association between gene methylation and sex, age>65, ISS stage, presence of extramedullary disease, renal failure and bone disease. Kaplan-Meier curves were used to estimate the probabilities of survival and the Log-rank test to assess the statistical significance of differences in event rates. Results: Methylation in the CpG island of ASS1 was detected in 71.7% patients and of ASL in 37% patients, while simultaneous methylation in both genes was present in 10 patients. None of the two genes was detectably methylated in the control group. Patients with ASS1 methylation were less likely to have bone disease (p=0.04, OR=0.22) and extramedullary disease (p=0.05, OR=0.22) and a trend was also noted that these patients were less likely to be >65 years of age (p=0.2, OR=0.37). We did not detect any statistically significant difference in overall survival by methylation status of the studied genes in this small study size. Conclusions: We demonstrate for the first time that arginine biosynthesis genes ASS1 and ASL are methylated in MM.Methylation of ASS1 was found to be more frequent and negatively associated with bone or extramedullary disease. Further evaluation of ASS1 and ASL is warranted in MM and supports the expansion of arginine deprivation trials in these patients
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».