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Enregistrement W2760872867 · doi:10.24870/cjb.2017-a56

Delineation of HIF1a mediated transcription program and the oncogenic signaling pathways in gastric tumors

2017· article· en· W2760872867 sur OpenAlexvenueno aff
Dhanasekaran Rathinam, Kumaresan Ganesan

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Biotechnology · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer, Hypoxia, and Metabolism
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHIF1ATranscription factorSignal transductionTranscription (linguistics)Cancer researchBiologyComputational biologyCell biologyGeneticsGeneAngiogenesis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

HIF1 is a transcription factor activated under hypoxic condition in many cancer types and has been implicated in cancer cell proliferation, invasion and energy metabolism. Towards understanding the role of HIF1 mediated transcription in gastric cancer, the HIF1 gene signatures established to date were analyzed for their expression across the mRNA profiles of gastric tumors. HIF1 regulated genes were identified to involve and associated with the signaling pathways and processes such as integrin signaling, Wnt, P53, EGF, FGF, VEGFA, PI3K, TGF and NFkB signaling pathways. The HIF1a genes were identified to play a significant role in energy metabolism including glycolysis, drug resistance due to epithelial to mesenchymal transition and cancer cell survival. In gastric tumors, the HIF1 regulated genes were observed to express in diffuse, poorly differentiated and stage-3 tumors. The analyses reveal i) activation of HIF1 in a sub-set of gastric tumors, ii) the pathways associated with the HIF1 activation in gastric tumors, and iii) genes involved in HIF1 mediated transcription in gastric cancer. We are further investigating the drugs that would best suit for this sub-set of tumors with activated HIF1.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,128
Score d'incertitude au seuil0,920

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,228
Écart entre enseignants0,216 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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