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Enregistrement W2760965090 · doi:10.1101/200725

Compensatory evolution via cryptic genetic variation: Distinct trajectories to phenotypic and fitness recovery

2017· preprint· en· W2760965090 sur OpenAlexafffund
Sudarshan Chari, Christian Marier, Cody Porter, Emmalee Northrop, Alexandra Belinky, Ian Dworkin

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2017
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEvolution and Genetic Dynamics
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaMichigan State UniversityNational Science Foundation
Mots-clésBiologyAlleleNatural selectionAdaptation (eye)Evolutionary biologyGeneticsPhenotypeGenetic variationBalancing selectionSelection (genetic algorithm)Experimental evolutionDrosophila melanogasterGenetic FitnessGeneNeuroscience

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Populations are constantly exposed to deleterious alleles, most of which are purged via natural selection. However, deleterious fitness effects of alleles can also be suppressed by compensatory adaptation. Compensatory mutations can act directly to reduce deleterious effects of an allele. Alternatively, compensation may also occur by altering other aspects of an organisms’ phenotype or performance, without suppressing the phenotypic effects of the deleterious allele. Moreover, the origin of allelic variation contributing to compensatory adaptation remains poorly understood. Compensatory evolution driven by mutations that arise during the selective process are well studied. However less is known about the role standing (cryptic) genetic variation plays in compensatory adaptation. To address these questions, we examined evolutionary trajectories of natural populations of Drosophila melanogaster fixed for mutations that disrupt wing morphology, resulting in deleterious effects on several components of fitness. Lineages subjected only to natural selection, evolved modifications to courtship behavior and several life history traits without compensation in wing morphology. Yet, we observed rapid phenotypic compensation of wing morphology under artificial selection, consistent with segregating variation for compensatory alleles. We show that alleles contributing to compensation of wing morphology have deleterious effects on other fitness components. These results demonstrate the potential for multiple independent avenues for rapid compensatory adaptation from standing genetic variation, which ultimately may reveal novel adaptive trajectories.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,217
Écart entre enseignants0,209 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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